30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0688 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0688  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  704    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0676  hypothetical protein  53.16 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00398993  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000616  hypothetical protein  42.24 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.643039  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0507  hypothetical protein  34.28 
 
 		 349 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3534  hypothetical protein  32.38 
 
 		 351 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0421  hypothetical protein  32.38 
 
 		 351 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4178  hypothetical protein  31.81 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0449  hypothetical protein  32.01 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0165  Multidrug resistance efflux pump-like protein  22.53 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  24.55 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  21.66 
 
 		 335 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148727  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.44 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0895  secretion protein HlyD family protein  24.44 
 
 		 405 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  23.79 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  25.24 
 
 		 333 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  24.81 
 
 		 347 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.49 
 
 		 448 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  28.28 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  29.46 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3187  secretion protein HlyD family protein  36.51 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2782  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.66 
 
 		 433 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1120  HlyD family protein secretion protein , membrane fusion protein  28.66 
 
 		 433 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121585  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  19.77 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  24.71 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  25.57 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  21.22 
 
 		 366 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  24.02 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  24.89 
 
 		 351 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  24.89 
 
 		 351 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>