16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0449 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0449  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  704    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3534  hypothetical protein  76.07 
 
 		 351 aa  544  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0421  hypothetical protein  76.07 
 
 		 351 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4178  hypothetical protein  75.21 
 
 		 351 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0507  hypothetical protein  54.89 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000616  hypothetical protein  33.71 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.643039  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0688  hypothetical protein  32.01 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0676  hypothetical protein  27.76 
 
 		 347 aa  142  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00398993  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0165  Multidrug resistance efflux pump-like protein  25.21 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0733  Multidrug resistance efflux pump-like protein  24.67 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.38 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  23.22 
 
 		 335 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.26 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  23.95 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2249  hypothetical protein  21.67 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  23.64 
 
 		 344 aa  42.7  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>