13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0421 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4178  hypothetical protein  91.74 
 
 		 351 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3534  hypothetical protein  99.72 
 
 		 351 aa  701    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0421  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  704    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0449  hypothetical protein  76.07 
 
 		 351 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0507  hypothetical protein  55.17 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000616  hypothetical protein  32.66 
 
 		 345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.643039  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0688  hypothetical protein  32.38 
 
 		 348 aa  193  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0676  hypothetical protein  30.95 
 
 		 347 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00398993  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0165  Multidrug resistance efflux pump-like protein  24.45 
 
 		 366 aa  86.3  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0733  Multidrug resistance efflux pump-like protein  25.07 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  23.46 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  23.31 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  25.41 
 
 		 302 aa  43.1  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>