12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4178 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4178  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  705    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3534  hypothetical protein  91.74 
 
 		 351 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0421  hypothetical protein  91.74 
 
 		 351 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0449  hypothetical protein  75.21 
 
 		 351 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0507  hypothetical protein  54.89 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000616  hypothetical protein  31.23 
 
 		 345 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.643039  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0688  hypothetical protein  31.81 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0676  hypothetical protein  28.94 
 
 		 347 aa  156  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00398993  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0165  Multidrug resistance efflux pump-like protein  23.63 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0733  Multidrug resistance efflux pump-like protein  26.12 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  22.47 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  23.73 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>