64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1770 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1770  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 128 aa  266  7e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2138  transcriptional regulatory protein  33.67 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.751524  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0041  sensory box protein  33.67 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 1049 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3948  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 717 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 717 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3766  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 717 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3822  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 717 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834811  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  27.17 
 
 		 1141 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  35.53 
 
 		 470 aa  52.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0543  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 717 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2469  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.57 
 
 		 747 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2641  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.36 
 
 		 1118 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.604832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3487  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.96 
 
 		 717 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 695 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5550  putative PAS/PAC sensor protein  30.19 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 657 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544  sensory box histidine kinase  20.59 
 
 		 717 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.96 
 
 		 1680 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  25.24 
 
 		 732 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 739 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.92 
 
 		 719 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  31.87 
 
 		 684 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0076  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.63 
 
 		 898 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2066  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 		 1167 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.082343  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 851 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.88 
 
 		 717 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2024  fused PAS sensor histidine kinase protein and response regulator  25.24 
 
 		 1005 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00627468  normal  0.216163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1568  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683844  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  20.34 
 
 		 823 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0993  putative PAS/PAC sensor protein  32.81 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.21 
 
 		 1118 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.21 
 
 		 1118 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 557 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3508  putative PAS/PAC sensor protein  26.5 
 
 		 554 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.44 
 
 		 878 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1998  ATP-binding region, ATPase-like protein  25.88 
 
 		 856 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 		 1721 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3675  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.74 
 
 		 966 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.21 
 
 		 1248 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  24.36 
 
 		 1120 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1434  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 		 1186 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.32 
 
 		 1121 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3711  LuxR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 637 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.731459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.11 
 
 		 1122 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2761  putative PAS/PAC sensor protein  30.59 
 
 		 143 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2133  putative PAS/PAC sensor protein  30.61 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 515 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 		 1291 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4051  putative PAS/PAC sensor protein  29.87 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.949542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1704  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 		 1168 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  25.61 
 
 		 512 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0214  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 		 500 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4928  sensory box protein  22.03 
 
 		 868 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1623  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 377 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  25.29 
 
 		 1119 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  29.63 
 
 		 1255 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2658  putative PAS/PAC sensor protein  26.61 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3857  putative PAS/PAC sensor protein  28.75 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.759378  normal  0.914632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4841  putative PAS/PAC sensor protein  32.47 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 		 512 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3152  sensory box protein  25.45 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.04 
 
 		 948 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>