More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0445 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0445  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  477  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1882  hypothetical protein  70.82 
 
 
234 aa  324  6e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  46.77 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  48 
 
 
266 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  49.25 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  41.14 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  34.62 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  34.2 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  38.83 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  38.79 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  33.51 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  40.26 
 
 
449 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  39.07 
 
 
745 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  39.58 
 
 
973 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  41.13 
 
 
447 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  36.41 
 
 
1033 aa  72  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  38.04 
 
 
214 aa  72  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  38.51 
 
 
576 aa  71.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  35.45 
 
 
216 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  31.52 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  36.5 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  27.35 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  36.3 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  33.88 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  33.75 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  34.1 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  38.57 
 
 
903 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  36.94 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  35.48 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  35.2 
 
 
340 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  34.52 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  36.18 
 
 
517 aa  68.6  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  31.28 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  36.02 
 
 
452 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  35.88 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  39.86 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  35.03 
 
 
489 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  33.78 
 
 
567 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
862 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  31.43 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  33.14 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  31.43 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  36.43 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  36.13 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  36.53 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.33 
 
 
14916 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  36.53 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  34.16 
 
 
521 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
776 aa  65.9  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  36.24 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  36.07 
 
 
332 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 
250 aa  65.1  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  35.26 
 
 
420 aa  65.1  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 
386 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  30.12 
 
 
370 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  33.13 
 
 
384 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 
412 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
438 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  35.62 
 
 
219 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  31.69 
 
 
446 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  31.05 
 
 
900 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  37.84 
 
 
184 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  33.72 
 
 
174 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  38.3 
 
 
204 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  32.24 
 
 
199 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  42.42 
 
 
292 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  35.82 
 
 
727 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
176 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
176 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  31.16 
 
 
401 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  31.16 
 
 
401 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  37.59 
 
 
325 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  33.99 
 
 
493 aa  62.4  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  30.43 
 
 
206 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  31.1 
 
 
300 aa  62  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
389 aa  62.4  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  29.9 
 
 
193 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0869  pentapeptide repeat protein  30.65 
 
 
233 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0841759  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  48.35 
 
 
204 aa  62  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  32.56 
 
 
175 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  37.4 
 
 
182 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  34.68 
 
 
450 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  44.21 
 
 
870 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  35.62 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  32.68 
 
 
1191 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  39.2 
 
 
293 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  32.9 
 
 
336 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  32.9 
 
 
336 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  33.74 
 
 
311 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  32.89 
 
 
294 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  31.79 
 
 
260 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  38.28 
 
 
156 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  31.61 
 
 
183 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1082  pentapeptide protein  31.9 
 
 
614 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
146 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  34.09 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 
212 aa  60.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  32.26 
 
 
312 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  34.46 
 
 
219 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  31.66 
 
 
441 aa  59.7  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>