More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4799 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4799  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 279 aa  577  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4412  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  84.17 
 
 		 279 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.209851 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4458  carbohydrate kinase  74.1 
 
 		 279 aa  411  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0267  ribokinase-like domain-containing protein  74.46 
 
 		 279 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3754  ribokinase-like domain-containing protein  73.74 
 
 		 279 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.415543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0268  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  73.02 
 
 		 279 aa  407  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133044 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0279  ribokinase-like domain-containing protein  74.46 
 
 		 283 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0383  ribokinase-like domain-containing protein  73.74 
 
 		 284 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0271  ribokinase-like domain-containing protein  74.1 
 
 		 283 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0275  PfkB domain protein  73.74 
 
 		 283 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0278  ribokinase-like domain-containing protein  74.1 
 
 		 283 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.365265  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0078  ribokinase-like domain-containing protein  73.48 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0098  PfkB  68.59 
 
 		 282 aa  374  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00218841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4125  ribokinase-like domain-containing protein  69.42 
 
 		 280 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0077  ribokinase-like domain-containing protein  66.43 
 
 		 281 aa  359  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3518  carbohydrate kinase  69.31 
 
 		 292 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  27.24 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  25.46 
 
 		 311 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  23.13 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  21.8 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  21.8 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  26.13 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  27.46 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  24.6 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  25.57 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  24.81 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  22.84 
 
 		 424 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  25.51 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  22.5 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  25.84 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  23.86 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  25.64 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  24.72 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  25.91 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  27.54 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  22.7 
 
 		 306 aa  62  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  25.42 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  23.55 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  25.27 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  23.11 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  25.27 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  25.27 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  25.27 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  23.99 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  23.79 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  26.69 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  24.31 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  27.43 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  23.08 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  23.33 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  28.17 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  26.53 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  28.17 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  27.72 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  24.36 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  25.35 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  26.1 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  24.43 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  23.33 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  28.08 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  24.48 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  26.12 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  24.57 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  23.27 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  21.74 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  24.41 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  21.58 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  24.22 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  24.41 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  25.85 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0252  PfkB domain protein  24.13 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1077  PfkB domain protein  24.6 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.679287 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  24.9 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  21.79 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  25.81 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  23.48 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  23.48 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  25.68 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  26.48 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  24.6 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  23.76 
 
 		 373 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  23.79 
 
 		 327 aa  57  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  27.88 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  25 
 
 		 330 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  26.35 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  22.3 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  24.58 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  22.06 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  26.27 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25.68 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  21.59 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  25.74 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  23.69 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  24.74 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  20.78 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  23.91 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  23.79 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  22.97 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  21.63 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>