More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00870 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  100 
 
 		 445 aa  875    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2589  PfkB domain protein  59.03 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2767  putative carbohydrate kinase  52.38 
 
 		 385 aa  349  7e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.634409  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2897  ribokinase-like domain-containing protein  52.22 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2607  PfkB domain protein  50.28 
 
 		 363 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000945109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5122  PfkB domain protein  51.6 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1520  PfkB domain protein  51.29 
 
 		 371 aa  309  5e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.395402  normal  0.0514354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  50.31 
 
 		 373 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  30.29 
 
 		 319 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5442  PfkB domain protein  34.52 
 
 		 311 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  30.87 
 
 		 314 aa  86.3  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  30.18 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  30.79 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  27.4 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  23.15 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  31.89 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  28.29 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  27.74 
 
 		 305 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  28.29 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  26.25 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  24.34 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  32.01 
 
 		 311 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  29.28 
 
 		 315 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  26.26 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  32.96 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  27.76 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  25.09 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.22 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  30.42 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  28.34 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  27.24 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.88 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  25.26 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  28.33 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  25.89 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  29.11 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  27.97 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  27.48 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  27.55 
 
 		 315 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.17 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  39.6 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.17 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  27.31 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  27.4 
 
 		 363 aa  66.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  27.17 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  25.27 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  29.04 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  27.17 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  27.65 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  25.48 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  27.17 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.17 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  27.05 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  26.4 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  29.15 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  25.25 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  27.02 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  27.59 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  27.83 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  25.32 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  28.33 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  28.21 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  28.34 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  25.16 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  23.31 
 
 		 308 aa  63.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  27.48 
 
 		 326 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  27.44 
 
 		 324 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  28.24 
 
 		 299 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  27.67 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  26.45 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  23.15 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  27.71 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  29.77 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  21.22 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  26.44 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  21.15 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  29.62 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  27.17 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  39.6 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  27.87 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  22.08 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  27.87 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  23.62 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  26.94 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5796  PfkB domain protein  29.21 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  28.08 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  22.61 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  22.58 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.47 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.42 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  23.53 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0597  ribokinase-like domain-containing protein  25.38 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  27.36 
 
 		 313 aa  59.7  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  23.99 
 
 		 320 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  26.35 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  28.78 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  24.16 
 
 		 298 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>