More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2370 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  100 
 
 		 316 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  99.68 
 
 		 316 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  72.06 
 
 		 320 aa  451  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  52.56 
 
 		 314 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  50.96 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  46.41 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  44.52 
 
 		 317 aa  275  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  46.08 
 
 		 319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  44.9 
 
 		 313 aa  258  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  39.59 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  37.54 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  35.84 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  34.26 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  31.93 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  28.96 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  28.28 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  28.28 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  28.28 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.95 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  28.28 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  27.61 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.95 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  29.94 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  29.86 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  23.64 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  26.94 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  29.77 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  29.49 
 
 		 642 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4101  PfkB family kinase  29.1 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0130  ribokinase-like domain-containing protein  29.1 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.964935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4025  PfkB family kinase  29.1 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  27.86 
 
 		 315 aa  93.2  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  29.47 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  28.21 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  27.62 
 
 		 645 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  30.08 
 
 		 327 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  29.31 
 
 		 308 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.41 
 
 		 320 aa  89.4  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  26.47 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  25.27 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  28.24 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  27.56 
 
 		 634 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  28.87 
 
 		 320 aa  86.3  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  29.29 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  26.89 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  25.83 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  28.85 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  28.62 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  29.88 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  30.36 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  28.38 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  28.38 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.02 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  28.42 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  27.52 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  25.16 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  26.1 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  29.05 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  28.77 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  24.74 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1034  ribokinase-like domain-containing protein  27.09 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.347997 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  28.03 
 
 		 635 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5595  PfkB domain protein  28.23 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  27.2 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.2 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  27.62 
 
 		 644 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2533  PfkB domain protein  30.51 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  28.23 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  25.45 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  27.99 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  27.94 
 
 		 644 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  26.74 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  26.74 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  26.74 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  25.8 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  28.22 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  27.13 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  29.7 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  26.64 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  29.58 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0284  ribokinase-like domain-containing protein  28.43 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0679012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  23.72 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  25.26 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 		 646 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  28.79 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  28.31 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  27.16 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  28.07 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  26.51 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25.76 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  24.65 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  26.72 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  24.9 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  26.04 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.75 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  25.67 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  26.75 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>