More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4101 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4025  PfkB family kinase  99.1 
 
 		 335 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0130  ribokinase-like domain-containing protein  99.1 
 
 		 335 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.964935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4101  PfkB family kinase  100 
 
 		 335 aa  689    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5595  PfkB domain protein  78.72 
 
 		 333 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0284  ribokinase-like domain-containing protein  77.25 
 
 		 334 aa  491  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0679012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1034  ribokinase-like domain-containing protein  68.77 
 
 		 337 aa  447  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.347997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0268  PfkB domain protein  35.99 
 
 		 350 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0297  PfkB domain protein  36.9 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4086  ribokinase-like domain-containing protein  39.2 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319245  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0686  ribokinase-like domain-containing protein  30.17 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  30.71 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  30.71 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  28.42 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  28.42 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  27.63 
 
 		 320 aa  89.7  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  26.9 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  25.63 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  25.6 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  27.01 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  27.87 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  28.7 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  27.64 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  25.67 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  28.9 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  27.05 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  25.74 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  24.57 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  21.96 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  21.68 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  26.22 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  28.48 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  22.58 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  24.09 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  24.21 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  23.93 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.37 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2294  ribokinase-like domain-containing protein  27.42 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  22.4 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  24.77 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  22.92 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  25.95 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  24 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  23.69 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  23.05 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  23.69 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  24.32 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  22.29 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  22.12 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  23.69 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  25.08 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  23.18 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2533  PfkB domain protein  25.07 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  25.88 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  29.64 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  23.18 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  21.83 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  23.69 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  24.9 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  23.69 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  23.18 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  23.18 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  20.68 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  23.18 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  23.69 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  23.69 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  25.48 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  21.17 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  23.53 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  25.82 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  21.04 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  24.23 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  23.05 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  23.05 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  24.46 
 
 		 312 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  24.25 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  21.47 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  27.12 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  23.75 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  23.53 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  23.53 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  23.53 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  24.15 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  23.53 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  23.9 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  23.81 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  21.15 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  32.95 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  23.9 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2598  PfkB  25.61 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.098069  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  23 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  21.73 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  25.78 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  23.08 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  27.91 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  25.61 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  22.85 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  25.61 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  26.52 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  23.24 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>