More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3563 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  100 
 
 		 300 aa  585  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  49.33 
 
 		 308 aa  254  9e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  39.12 
 
 		 319 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  44.22 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  38.78 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  37.84 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  40.14 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  36.77 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  36.64 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  35.84 
 
 		 316 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  35.49 
 
 		 316 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  28.99 
 
 		 317 aa  95.9  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  25.34 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.19 
 
 		 315 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  26.19 
 
 		 315 aa  92  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.19 
 
 		 315 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.19 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.19 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.19 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29.19 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25.72 
 
 		 323 aa  89.7  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  25.51 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  26.49 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  30.74 
 
 		 318 aa  87.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  35.62 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  24.83 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  28.57 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  30.12 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  25.1 
 
 		 315 aa  86.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  25 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  27.08 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  25.4 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.13 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.13 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.13 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  27.65 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  33.08 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  24.71 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  25.51 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  27.02 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  31.27 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  23.13 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  26.54 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  32.14 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  26.61 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  29.83 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  29.19 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  30.56 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5595  PfkB domain protein  27.92 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  31.11 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  23.86 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  28.09 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  22.07 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  25.42 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.48 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  28.52 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  31.35 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  31.99 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  24.62 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  24.91 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  27.9 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.04 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  32.06 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  21.79 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  28.23 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  28.81 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  24.68 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  31.64 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  33 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  27.8 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.75 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  25.08 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  30.17 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  29.66 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  26.14 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  25.76 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  26.14 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  26.14 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  26.14 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  26.14 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  27.9 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  28.92 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  27.1 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  27 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  23.29 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  27.24 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  25.33 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  28.9 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  29.33 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  30.51 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  22.07 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2533  PfkB domain protein  27.11 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  25.47 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1072  PfkB  30.74 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  29.68 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  25.35 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  26.95 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>