More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1072 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1072  PfkB  100 
 
 		 295 aa  567  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  44.93 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  45.64 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  42.28 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  46.05 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  46.55 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  35.76 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  42.72 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  46.13 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  41.06 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  40.85 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  43.71 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  38.87 
 
 		 307 aa  179  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  43.81 
 
 		 307 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  35.57 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  43.29 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  45.48 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  41.87 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  38.91 
 
 		 313 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  45.58 
 
 		 318 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  44.59 
 
 		 309 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  40.4 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  38.21 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  35.99 
 
 		 290 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  37.24 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  37.75 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  34.32 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  44.26 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  40.51 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  40.13 
 
 		 299 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  39.34 
 
 		 305 aa  172  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  40.2 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  42.57 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  41.58 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  37.5 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  39.86 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  46.82 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  40.47 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  42.95 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  46.82 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  40.52 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  46.82 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  42 
 
 		 302 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  41.38 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  42.47 
 
 		 296 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  43.19 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  40.98 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  44.48 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  42.63 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  42.57 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  40.27 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  37.71 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  44.48 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  38.63 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  41.83 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  43.81 
 
 		 326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  43.52 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  49.65 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  45.48 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  40.4 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  45.55 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  35.02 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  40.74 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01080  sugar kinase, ribokinase  42.45 
 
 		 349 aa  162  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  32.53 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  37.25 
 
 		 403 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  41.08 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  37.58 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  40.33 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  40.4 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3132  ribokinase-like domain-containing protein  43.65 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509823 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  44.52 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  33.43 
 
 		 345 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  41.95 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  40.74 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  40.53 
 
 		 308 aa  158  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  43.65 
 
 		 306 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  40.74 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  36.33 
 
 		 317 aa  157  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  42.16 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  38.94 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  43.14 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  39 
 
 		 308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  36.12 
 
 		 303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  36.12 
 
 		 303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  39 
 
 		 308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  39 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  36.45 
 
 		 307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  38.87 
 
 		 309 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  37.7 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  35.79 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  38.24 
 
 		 353 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  36.09 
 
 		 398 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  38.87 
 
 		 309 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  38.87 
 
 		 309 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  38.87 
 
 		 309 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  38.87 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  32.33 
 
 		 340 aa  152  5e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  42.71 
 
 		 322 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  38.54 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>