More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3998 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 308 aa  599  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  49.33 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  48.98 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  37.1 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  36.77 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  36.36 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  38.89 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  34.43 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  38.41 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  38.41 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  34.52 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  36.18 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.03 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.03 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  27.03 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  27.03 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.03 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  26.69 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  27.36 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.69 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.02 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  32.94 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.04 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.97 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.97 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.97 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  32.09 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  31.88 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2533  PfkB domain protein  33.44 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2598  PfkB  33.56 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.098069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  33.45 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  34.64 
 
 		 300 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  30.28 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  25.68 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  33.21 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04860  argininosuccinate lyase  33.21 
 
 		 823 aa  98.6  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  29.52 
 
 		 313 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  25.6 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  34.83 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  29.1 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  29.29 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  29.35 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  34.02 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  29.35 
 
 		 320 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.23 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  30.82 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  29.35 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  27.64 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.41 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  29.17 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  27.94 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  31.25 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  29.39 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  26.69 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  34.09 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  29.7 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  32.53 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  26.8 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  26.8 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  26.8 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  26.8 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  26.8 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  26.89 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  26.89 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  36.22 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  32.52 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  30.8 
 
 		 338 aa  86.7  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  34.85 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.54 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  30.03 
 
 		 328 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  30.24 
 
 		 304 aa  85.9  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  26.64 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  23.37 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  33.1 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  32.04 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  29.66 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.8 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  27.84 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  24.34 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  23.76 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  30.8 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  26.64 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  27.1 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  26.62 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  22.77 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  33.68 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  32.17 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5595  PfkB domain protein  30.82 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  26.71 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  27.95 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  30.95 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  29.06 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.48 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  23.05 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.32 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  30.07 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  34.3 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  33.33 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  30.37 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>