More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4060 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 314 aa  625  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  52.88 
 
 		 316 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  52.56 
 
 		 316 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  51.13 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  48.74 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  48.74 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  49.68 
 
 		 320 aa  275  9e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  49.68 
 
 		 313 aa  275  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  47.42 
 
 		 317 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  43 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  39.93 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  40.07 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  34.17 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  28.28 
 
 		 312 aa  108  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  26.42 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.67 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.67 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.42 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.42 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.76 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.76 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  26.35 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.09 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  25.32 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  25.91 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  29.04 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  29.43 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  29.77 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  27 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.44 
 
 		 323 aa  92.4  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  29.71 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  31.19 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  28.72 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  26.67 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  28.82 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  25.71 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  25.71 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  26.6 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  25.71 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  30.79 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.82 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  26.58 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.35 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  25.75 
 
 		 310 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  28.8 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  27.21 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  29.62 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  27.69 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  27.97 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  30.3 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  30.3 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  27.47 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  26.99 
 
 		 293 aa  85.9  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  28.57 
 
 		 344 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  28.43 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  28.85 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  28.94 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  31.05 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  30.94 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  27.83 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  26.37 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  27.04 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  27.51 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  28.29 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  28.25 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  28.25 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  29.45 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  26.56 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4487  carbohydrate kinase, PfkB  29.57 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.47 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  29.03 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  27.36 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  26.86 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1034  ribokinase-like domain-containing protein  27.56 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.347997 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  28.94 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  29.44 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  28.05 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.96 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  27.18 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  25.72 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  22.61 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  27.01 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  27.05 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  28.63 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  29.58 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  27.01 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  26.67 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  28.48 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  26.77 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  27.33 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  26.69 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  27.71 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  25.32 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04860  argininosuccinate lyase  31.41 
 
 		 823 aa  78.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  31.62 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  27.83 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  28.12 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  26.69 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  28.75 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>