More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5137 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  100 
 
 		 319 aa  638    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  51.13 
 
 		 314 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  50.96 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  50.96 
 
 		 316 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  45.4 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  45.78 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  41.23 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  41.23 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  40.65 
 
 		 317 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  39.25 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  36.93 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  34.52 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  32.03 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  30.98 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  29.93 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  29.93 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  29.93 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  28.25 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  30.27 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  29.59 
 
 		 315 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  29.59 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  29.59 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  30.06 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  28.91 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  30.12 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  25.82 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  28.03 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  28.39 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  28.39 
 
 		 320 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  27.15 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.49 
 
 		 329 aa  92.4  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  28.85 
 
 		 304 aa  92.4  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  25.62 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  31.12 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  30.29 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  31.12 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  31.12 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  31.12 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  29.02 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  25.44 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  30.71 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  28.75 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  24.22 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  30.29 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  29.43 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  27.68 
 
 		 304 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  30.29 
 
 		 330 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  26.21 
 
 		 319 aa  85.9  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  26.54 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  26.54 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  24.91 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  26.54 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  26.54 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  27.91 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  26.54 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.46 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  29.46 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  29.05 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.05 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  24.12 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  31.1 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  26.8 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  29.24 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  25.76 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  26.27 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  28.17 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  26.79 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  28.29 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  28.06 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  26.27 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.36 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  25.31 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  25.38 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  28.04 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  27.36 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  27.42 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  27.24 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  25.94 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  23.43 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  27.89 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  25.95 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  24.73 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  27.35 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  23.19 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  25.36 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  26.76 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  25.71 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  27.34 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  25.93 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  28.32 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  22.43 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  25.99 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  21.11 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  26.79 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  24.52 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  25.32 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  26.75 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  25.27 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  26.04 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  26.99 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>