More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1888 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  100 
 
 		 323 aa  640    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  42.3 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  40.13 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  39.81 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  39.24 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  40.66 
 
 		 309 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0545  ribokinase-like domain-containing protein  43.92 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.747031  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  35.81 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  39.4 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  39.74 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2205  PfkB  40.92 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.503057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  38.56 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  34.74 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  39.67 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  41.91 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  37.75 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  37.79 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  35.99 
 
 		 307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  36 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  38.11 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  35.67 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  39.23 
 
 		 308 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  39.66 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  37.87 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  42.86 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  38.46 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  38 
 
 		 305 aa  180  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  36.93 
 
 		 307 aa  179  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  33.44 
 
 		 310 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  36.75 
 
 		 403 aa  178  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  37.07 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  40.68 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  37.87 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  37.87 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  38 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  37.66 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  36.07 
 
 		 308 aa  175  8e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  37.82 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  39.74 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  39.74 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  39.86 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  37.1 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  38.08 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  35.11 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  37.21 
 
 		 303 aa  173  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  38.44 
 
 		 295 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  39.02 
 
 		 305 aa  172  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  31.91 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  36.98 
 
 		 313 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  38.64 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  34.97 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  34.97 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  38.03 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  34.97 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  39.4 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  37.97 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  38.7 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  35.79 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  37.97 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  39.74 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  38.36 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  32.23 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  35.23 
 
 		 398 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  37.63 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  41.78 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  35.45 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  37.17 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  36.12 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  36.12 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  36.67 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  35.02 
 
 		 303 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  32.45 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  37.72 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  38.7 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  36.86 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  37.21 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  37.21 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  37.21 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  37.21 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  37.21 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  37.21 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  37.37 
 
 		 309 aa  164  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  37.21 
 
 		 314 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  39.86 
 
 		 315 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  35.64 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  41.89 
 
 		 296 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  36.68 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  35.14 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  31.05 
 
 		 404 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  31.05 
 
 		 404 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  31.05 
 
 		 404 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  31.05 
 
 		 404 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  37.09 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  33.87 
 
 		 302 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  35.91 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  31.05 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  35.54 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  33.87 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7825  putative ribokinase  39.81 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  35.28 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>