More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2720 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  100 
 
 		 313 aa  633  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  49.68 
 
 		 314 aa  289  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  47.9 
 
 		 319 aa  269  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  47.9 
 
 		 319 aa  269  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  47.52 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  44.9 
 
 		 316 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  44.59 
 
 		 316 aa  261  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  45.78 
 
 		 319 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  42.95 
 
 		 320 aa  252  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  37.46 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  36.64 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  34.43 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  33.12 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  29.81 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  29.49 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  29.49 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  29.49 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  29.49 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  29.49 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  29.49 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  30 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  28.85 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.3 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  31.58 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  29.82 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  31.23 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.23 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.88 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  27.19 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  29.85 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  29.41 
 
 		 314 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  29.85 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  30.2 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  26.88 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  27.1 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  27.7 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  30.86 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  29.85 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  32.09 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  30.98 
 
 		 316 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  28.39 
 
 		 317 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  29.3 
 
 		 319 aa  96.3  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  29.64 
 
 		 316 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  26.52 
 
 		 314 aa  95.9  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  29.1 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  27.72 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  30.26 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  27.74 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  29.64 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  30.2 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  32.43 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  30.26 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  27.24 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  30.26 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  30.26 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  30.11 
 
 		 330 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  30.19 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  30.11 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  30.31 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.09 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  26.8 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  28.87 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  22.92 
 
 		 645 aa  89  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  29.72 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  28.83 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  27.57 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  28.87 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  22.51 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  27.65 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  24.84 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  27.63 
 
 		 318 aa  87  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  27.37 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  29.62 
 
 		 318 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0639  PfkB  31.48 
 
 		 323 aa  86.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  28.41 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  30.11 
 
 		 311 aa  86.3  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  31.03 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  29.27 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  27.31 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  27.51 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  28.14 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  27.59 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  26.39 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  26.45 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  29.17 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2533  PfkB domain protein  26.95 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  30.31 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  30.31 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  26.16 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  27.84 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  30.07 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  24.26 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  29.27 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  26.87 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  24.24 
 
 		 642 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.2 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  30.24 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  28.66 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>