More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2533 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2533  PfkB domain protein  100 
 
 
379 aa  749    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2598  PfkB  57.26 
 
 
382 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.098069  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  43.41 
 
 
680 aa  187  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  27.36 
 
 
319 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  30.17 
 
 
317 aa  93.6  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  25.72 
 
 
317 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  27.3 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  26.38 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  26.61 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  26.84 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  30.51 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  30.51 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  26.06 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  25.55 
 
 
307 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  26.95 
 
 
313 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  28.32 
 
 
302 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  26.23 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  25.71 
 
 
628 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  25.39 
 
 
628 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  28.47 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  28.91 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  24.92 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  29.82 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  27.05 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  21.04 
 
 
290 aa  72.8  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  26.59 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  25.84 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  25.76 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  25.84 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0268  PfkB domain protein  26.91 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  26.94 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  27.86 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  27.11 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  26.65 
 
 
302 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5796  PfkB domain protein  31.56 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  29.59 
 
 
313 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  29.96 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  25.62 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  24.07 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  26.49 
 
 
642 aa  67.4  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  25.57 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  27.16 
 
 
345 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  22.97 
 
 
323 aa  67  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  25.82 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  27.54 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  26.99 
 
 
302 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  29.21 
 
 
307 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  27.84 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  26.25 
 
 
326 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  27.1 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  27.25 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  23.78 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  27.32 
 
 
347 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  24.12 
 
 
315 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  27.44 
 
 
314 aa  63.9  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  27.11 
 
 
316 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  23.73 
 
 
317 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04860  argininosuccinate lyase  30.59 
 
 
823 aa  63.5  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  26.75 
 
 
330 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2162  PfkB domain protein  27.93 
 
 
326 aa  63.9  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0183703  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  30.8 
 
 
316 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  27.47 
 
 
330 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  23.74 
 
 
655 aa  63.5  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  27.38 
 
 
306 aa  63.2  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  28.34 
 
 
329 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  29.85 
 
 
298 aa  63.2  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  26.71 
 
 
316 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  27.46 
 
 
308 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  26.44 
 
 
635 aa  62.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  28.12 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  29.85 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  28.17 
 
 
315 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  26.86 
 
 
316 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  27.47 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  26.27 
 
 
316 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3639  kinase, pfkB family  24.41 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000277248  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  29.45 
 
 
288 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  26.09 
 
 
329 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  27.21 
 
 
313 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  22.44 
 
 
322 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  30.18 
 
 
316 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  29.85 
 
 
316 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  26.81 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0297  PfkB domain protein  26.01 
 
 
352 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  28.53 
 
 
314 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  29.03 
 
 
329 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  24.34 
 
 
315 aa  60.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  26.43 
 
 
316 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  26.75 
 
 
322 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  25.92 
 
 
645 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  22.15 
 
 
310 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  26.96 
 
 
308 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  25.47 
 
 
319 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  25.53 
 
 
345 aa  60.1  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  27.95 
 
 
320 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.24 
 
 
329 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.8 
 
 
329 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  27.24 
 
 
329 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  27.33 
 
 
317 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>