More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4103 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  100 
 
 		 298 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  98.66 
 
 		 298 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  67 
 
 		 298 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  67 
 
 		 298 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  67 
 
 		 298 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  67 
 
 		 298 aa  391  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  67 
 
 		 298 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  66.67 
 
 		 298 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  66.33 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  66.33 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  66.33 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  66.33 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  66.33 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  46.78 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  42.56 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  38.57 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  39.86 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  36.18 
 
 		 326 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  35.67 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  32.78 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  33.67 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  34.67 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  31.67 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  35.14 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  35.37 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  34.56 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  32.31 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  34.02 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  32.2 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  34.09 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  29.53 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  32.99 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  30.49 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  33 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  29.04 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  30.36 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  26.25 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2455  PfkB domain-containing protein  37.16 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.287722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  30.33 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  28.71 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  28.33 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  31.56 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  28.72 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  29.32 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  26.58 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  28.95 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  31.38 
 
 		 313 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  29.04 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  28.99 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  29.97 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  28.99 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  29.97 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  27.21 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  31.6 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  30.29 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  31.23 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  30.19 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  27.51 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  32.45 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  30.65 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  27.69 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  27.69 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  26.69 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  27.69 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  27.69 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  27.69 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  29.6 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.3 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  31.31 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  28.67 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  30.8 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  28 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  28.3 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  26.47 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.81 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  26.97 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  30.85 
 
 		 315 aa  93.6  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  28 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  30.65 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  28 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  25.19 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  26.83 
 
 		 315 aa  93.2  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  28.97 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  30.59 
 
 		 309 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  28.57 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  28.24 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  29.89 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  28 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  29.55 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5220  PfkB domain protein  30.69 
 
 		 313 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.946183  normal  0.655823 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  28 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1475  ribokinase-like domain-containing protein  30.24 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  27.18 
 
 		 298 aa  92  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  27.22 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  29.97 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  28.09 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  26.52 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  30.59 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  27.91 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>