More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1034 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1034  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
337 aa  684    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.347997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4025  PfkB family kinase  68.47 
 
 
335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4101  PfkB family kinase  68.77 
 
 
335 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0130  ribokinase-like domain-containing protein  68.47 
 
 
335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.964935  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5595  PfkB domain protein  68.69 
 
 
333 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0284  ribokinase-like domain-containing protein  67.88 
 
 
334 aa  414  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0679012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0268  PfkB domain protein  39.94 
 
 
350 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0297  PfkB domain protein  39.64 
 
 
352 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4086  ribokinase-like domain-containing protein  42.77 
 
 
346 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319245  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0686  ribokinase-like domain-containing protein  32.2 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  27.95 
 
 
320 aa  96.7  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  28.74 
 
 
316 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  28.35 
 
 
316 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.6 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  26.14 
 
 
319 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  26.6 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  26.14 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  29.77 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  25.55 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  28.75 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  26.77 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  27.48 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  25.84 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2598  PfkB  29.17 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.098069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  31.17 
 
 
304 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.47 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  23.05 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  23.05 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  27.63 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  28.87 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  23.05 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  29.93 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  23.05 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  23.05 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  23.05 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  23.05 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  25.41 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  28.78 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  28.3 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  26.97 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  26.03 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  29.09 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  24.56 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2533  PfkB domain protein  27.12 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  27.76 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  24.21 
 
 
311 aa  67  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2294  ribokinase-like domain-containing protein  28.72 
 
 
317 aa  67  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  30.19 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  24.92 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  27.42 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  27.42 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  27.42 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  28.01 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  27.42 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  24.44 
 
 
320 aa  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  25.41 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  22.36 
 
 
310 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  24.7 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  25 
 
 
316 aa  63.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  28.19 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  22.98 
 
 
328 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  24 
 
 
305 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  24.23 
 
 
315 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  25.36 
 
 
326 aa  63.2  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  25.9 
 
 
310 aa  63.2  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  26.47 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  23.53 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  24.77 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  26.6 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  24.46 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  22.58 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  24.77 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  24.62 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  22.19 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  22.78 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  22.18 
 
 
304 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  28.31 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  22.18 
 
 
304 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  26.6 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  23.49 
 
 
307 aa  61.2  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  24.77 
 
 
311 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  22.76 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  20.77 
 
 
319 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  26.63 
 
 
331 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  27.35 
 
 
310 aa  60.1  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  26.37 
 
 
311 aa  59.7  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  25.08 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  27.4 
 
 
319 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  25.08 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  25.15 
 
 
341 aa  59.3  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  25.08 
 
 
314 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  28.73 
 
 
302 aa  59.3  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  25.08 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  26.71 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  25.08 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  25.08 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3505  PfkB  23.22 
 
 
298 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  25.08 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  25.08 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  26.79 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>