More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5595 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5595  PfkB domain protein  100 
 
 
333 aa  688    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0284  ribokinase-like domain-containing protein  84.64 
 
 
334 aa  531  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0679012 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4025  PfkB family kinase  79.82 
 
 
335 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0130  ribokinase-like domain-containing protein  79.82 
 
 
335 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.964935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4101  PfkB family kinase  79.2 
 
 
335 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1034  ribokinase-like domain-containing protein  68.69 
 
 
337 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.347997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0268  PfkB domain protein  35.69 
 
 
350 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0297  PfkB domain protein  36.98 
 
 
352 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4086  ribokinase-like domain-containing protein  37.96 
 
 
346 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319245  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0686  ribokinase-like domain-containing protein  30.85 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  30.25 
 
 
319 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  30.25 
 
 
319 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  29.41 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  27.17 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 
316 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  29.13 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  26.45 
 
 
314 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  30.92 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  27.92 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  28.93 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  26.55 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.59 
 
 
322 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  25.91 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  28.03 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  29.69 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  23.05 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.6 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  26.3 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  23.6 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  24.65 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  23.71 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  22.54 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  24.46 
 
 
295 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  24.84 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  27.56 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  26.76 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  26.43 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2294  ribokinase-like domain-containing protein  26.33 
 
 
317 aa  63.5  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  21.79 
 
 
307 aa  63.5  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  26.13 
 
 
305 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  25 
 
 
313 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  22.8 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  24.41 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  27.82 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  25.46 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  25.4 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2598  PfkB  26.23 
 
 
382 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.098069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  24.14 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  27.82 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  23.34 
 
 
306 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  24.14 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  23.78 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  23.34 
 
 
306 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  23.34 
 
 
306 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  23.34 
 
 
306 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  23.34 
 
 
306 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  24.14 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  24.14 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.14 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  24.14 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  25.36 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  24.14 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1475  ribokinase-like domain-containing protein  25.57 
 
 
305 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  25.26 
 
 
323 aa  60.1  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  24.4 
 
 
310 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  25.52 
 
 
301 aa  59.3  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  25.76 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  36.17 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.16 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  21.15 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  23.55 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  24.14 
 
 
326 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  21.55 
 
 
314 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  22.07 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  23.71 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  22.77 
 
 
313 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  22.77 
 
 
313 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  22.77 
 
 
313 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  23.08 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  25.78 
 
 
325 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  26.26 
 
 
312 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  27.36 
 
 
322 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  24.26 
 
 
341 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  22.5 
 
 
301 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  23.36 
 
 
344 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  27.92 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  22.18 
 
 
380 aa  56.2  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  23.38 
 
 
324 aa  55.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  23.92 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  24.55 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  22.57 
 
 
305 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  23.34 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  24.83 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  24.82 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  26.2 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  25.19 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  23.02 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  24.41 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  22.22 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  24.06 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>