More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0130 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0130  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
335 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.964935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4101  PfkB family kinase  99.1 
 
 
335 aa  682    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4025  PfkB family kinase  100 
 
 
335 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5595  PfkB domain protein  79.33 
 
 
333 aa  501  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0284  ribokinase-like domain-containing protein  77.78 
 
 
334 aa  491  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0679012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1034  ribokinase-like domain-containing protein  68.47 
 
 
337 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.347997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0268  PfkB domain protein  35.78 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0297  PfkB domain protein  36.69 
 
 
352 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4086  ribokinase-like domain-containing protein  39.2 
 
 
346 aa  172  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319245  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0686  ribokinase-like domain-containing protein  29.83 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  30.71 
 
 
316 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  30.71 
 
 
316 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  28.77 
 
 
319 aa  93.2  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  28.77 
 
 
319 aa  92.8  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  27.73 
 
 
320 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  27.59 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  25.72 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  27.09 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  27.87 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  27.01 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  25.67 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  27.56 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  28.4 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  27.4 
 
 
314 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  29.24 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  26.07 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  21.96 
 
 
290 aa  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  24.57 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  21.68 
 
 
307 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  28.48 
 
 
318 aa  62.8  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  25.91 
 
 
326 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  23.93 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  24.09 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  22.26 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.37 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  26.62 
 
 
317 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  24.77 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  23.53 
 
 
306 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  23.53 
 
 
306 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  23.53 
 
 
306 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  23.53 
 
 
306 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  23.53 
 
 
306 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  25.29 
 
 
301 aa  59.7  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  20.99 
 
 
328 aa  59.3  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  24.38 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  22.4 
 
 
334 aa  59.3  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  22.29 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  22.12 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  23.21 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  21.79 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  23.69 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  25.88 
 
 
332 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  29.64 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  24.32 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2294  ribokinase-like domain-containing protein  26.76 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  23.05 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  21.25 
 
 
404 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  21.25 
 
 
404 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  22.04 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  25.39 
 
 
313 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  21.25 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  21.83 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  21.25 
 
 
404 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  27.12 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  26.98 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2533  PfkB domain protein  25.07 
 
 
379 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  22.98 
 
 
298 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  24.04 
 
 
345 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  34.09 
 
 
335 aa  56.6  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  23.4 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  23.75 
 
 
303 aa  56.6  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  24.23 
 
 
319 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  26.89 
 
 
307 aa  56.2  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  23.05 
 
 
298 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  25.45 
 
 
314 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  23.05 
 
 
298 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  24.46 
 
 
312 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  24.15 
 
 
320 aa  55.8  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  22.98 
 
 
298 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  23.66 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  22.76 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  20.94 
 
 
404 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  21.04 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  22.98 
 
 
298 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  21.18 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  24.25 
 
 
315 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  23.66 
 
 
309 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  27.71 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  22.98 
 
 
298 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  22.98 
 
 
298 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  24.44 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  22.42 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  25.47 
 
 
645 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2598  PfkB  25.89 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.098069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3505  PfkB  24.11 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  27.91 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  22.73 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  22.76 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  22.76 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>