More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0283 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  100 
 
 		 292 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  46.34 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  38.68 
 
 		 401 aa  202  6e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0921  ketohexokinase  44.48 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2848  ketohexokinase  39.1 
 
 		 290 aa  195  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0029  Ketohexokinase  43.15 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.892362  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10054  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  29.48 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  31.84 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  28.82 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  33.11 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  34.48 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  27.64 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  25.53 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  24.38 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  29.41 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  27.3 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  27.24 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  26.16 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  27.34 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  21.32 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  28.36 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  28.26 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  21.31 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  24.56 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  27.17 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  24.74 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  27.89 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  19.69 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  30.25 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  28.63 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5455  ribokinase-like domain-containing protein  31.33 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354613  normal  0.536806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  29.29 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  25.09 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  20.08 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  21.15 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  20.08 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  30.57 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  25.09 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  21.15 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  24.05 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  28.85 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  29.47 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  20.08 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  20.08 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  25.09 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  26.25 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  30.4 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  20.08 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  28.03 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  23.35 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  29.12 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  26.25 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  28.81 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  26.42 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  27.09 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  27.09 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  25.5 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  28.18 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  25.82 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  24.23 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  28.38 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  25.85 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  23.94 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  28.08 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  28.14 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  26.26 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  24.79 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  28.2 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  26.71 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  21.53 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  23.45 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  30.08 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  29.8 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  26.1 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  24.54 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  29.69 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  24.83 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  27.85 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  25.18 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  24.54 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  25.18 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  21.79 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  25.18 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  25.18 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  23.88 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  24.27 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  25.18 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  27.76 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  27.56 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  26.53 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1559  PfkB domain protein  28.74 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  29.73 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  27.35 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  27.3 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  25.68 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  25.96 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>