More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3518 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3518  carbohydrate kinase  100 
 
 		 292 aa  597  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0383  ribokinase-like domain-containing protein  71.43 
 
 		 284 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0275  PfkB domain protein  71.53 
 
 		 283 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0271  ribokinase-like domain-containing protein  71.89 
 
 		 283 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0279  ribokinase-like domain-containing protein  71.53 
 
 		 283 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0278  ribokinase-like domain-containing protein  71.53 
 
 		 283 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.365265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4458  carbohydrate kinase  70.4 
 
 		 279 aa  388  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0267  ribokinase-like domain-containing protein  70.76 
 
 		 279 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3754  ribokinase-like domain-containing protein  70.4 
 
 		 279 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.415543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0268  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  70.4 
 
 		 279 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4412  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  70.76 
 
 		 279 aa  378  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.209851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4799  ribokinase-like domain-containing protein  69.31 
 
 		 279 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4125  ribokinase-like domain-containing protein  67.99 
 
 		 280 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0078  ribokinase-like domain-containing protein  69.61 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0077  ribokinase-like domain-containing protein  65.12 
 
 		 281 aa  358  9e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0098  PfkB  63.48 
 
 		 282 aa  339  4e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00218841  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.82 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  28.31 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  29.46 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  26.84 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  25.82 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  25.82 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  25.82 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  30.6 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  25.82 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  28.51 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  28.21 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  28.57 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  29.7 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  27.78 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  26.52 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  25.45 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  28.03 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  25.09 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  24.33 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2767  putative carbohydrate kinase  25.71 
 
 		 385 aa  62.4  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.634409  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  23.29 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  26.16 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  26.21 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  25.64 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  26.16 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  23.29 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  26.22 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  23.29 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  23.29 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  23.29 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  24.38 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  27.68 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  24.02 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  22.83 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  23.81 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  22.83 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  24.8 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  24.8 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  26.74 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  22.83 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  27.64 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  23.63 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  26.4 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  23.36 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  29.33 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  26.35 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3352  ribokinase family sugar kinase  27.5 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38232  decreased coverage  0.00309735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  30.08 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  25.37 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  24.73 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  22.51 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  27.51 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  25.7 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  27.97 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  22.51 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  23.31 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  27.88 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  23.69 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  29.32 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  24.48 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  27.27 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  25 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  25.29 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  46.67 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  21.97 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  26.06 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  23.93 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  24.31 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  24.14 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  25.82 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  24.64 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  25.42 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  26.46 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  23.53 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  25.26 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  34.65 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  23.53 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  20.94 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  34.65 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  34.65 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2810  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  28.9 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>