More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2767 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2767  putative carbohydrate kinase  100 
 
 		 385 aa  779    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.634409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1520  PfkB domain protein  58.74 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.395402  normal  0.0514354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5122  PfkB domain protein  58.26 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2589  PfkB domain protein  53.49 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2607  PfkB domain protein  53.09 
 
 		 363 aa  349  5e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000945109 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  52.38 
 
 		 445 aa  349  5e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2897  ribokinase-like domain-containing protein  53.82 
 
 		 387 aa  342  9e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  51.51 
 
 		 373 aa  322  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5442  PfkB domain protein  33.1 
 
 		 311 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  26.41 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.49 
 
 		 305 aa  93.2  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  27.4 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.13 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  26.51 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  31.05 
 
 		 307 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  29.33 
 
 		 307 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  28.08 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  30.77 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  30.77 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  29.67 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.54 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  25.36 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.96 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  30.38 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  30.38 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  30.38 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  29.1 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  26.9 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  28.33 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  28.87 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  24.45 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  30 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  27.92 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  29.59 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  28.94 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  28.41 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  28.14 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  30 
 
 		 315 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  29.73 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  28.57 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  27.11 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  26.35 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  27.36 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  28.89 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  28 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  27.36 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  31.18 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  26.11 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  28.4 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  25.71 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  26.45 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  24.64 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  26.99 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  30.63 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  30.63 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  30.63 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  29.77 
 
 		 295 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  28 
 
 		 298 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  26.76 
 
 		 317 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  27.74 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  28 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  29.2 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  29.34 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  28 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  27.67 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  28 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  29.33 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  28 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  28.32 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  25.83 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  27.67 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  26.92 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  27.09 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  22.38 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  27.33 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  25.51 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  27.02 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  27.82 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  22.98 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  29.45 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  26.13 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  26.86 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  31.29 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  23.41 
 
 		 644 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  25.94 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  27.4 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  28.01 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  26.4 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0597  ribokinase-like domain-containing protein  29.25 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  31.9 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  26.35 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  26.13 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  27.82 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  31.9 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  26.22 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  24.58 
 
 		 655 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  26.6 
 
 		 297 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  25.97 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  30.1 
 
 		 304 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.65 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>