More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2548 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  100 
 
 		 306 aa  631  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  63.99 
 
 		 297 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  63.41 
 
 		 285 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0505  ribokinase-like domain-containing protein  29.93 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000868793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  34.07 
 
 		 308 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3082  PfkB domain protein  28.85 
 
 		 284 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.925823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2948  ribokinase-like domain-containing protein  29.13 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.64332 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2985  carbohydrate kinase, PfkB  29.03 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0222551  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  24.91 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  30.73 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3183  PfkB domain protein  27.38 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1424  PfkB domain protein  26.91 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0143  ribokinase-like domain-containing protein  28.21 
 
 		 259 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000113671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  32.12 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  24.2 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  24.11 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  24.64 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  35.34 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  24.28 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  26.12 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  27.5 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  38.46 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  23.51 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  28.74 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  26.67 
 
 		 403 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  34.43 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  22.81 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  29.84 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1200  PfkB domain protein  25.2 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.460127  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  22.11 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  34.51 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  33.94 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  29.03 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  29.03 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  29.03 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  33.94 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  29.03 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  29.03 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  29.03 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  26.94 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  31.06 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  41.05 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  31.43 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  30.77 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  29.33 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  26.36 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  27.19 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  26.67 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  28.23 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  25 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  22.92 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  21.84 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  31.73 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  42.67 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  32.76 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  28.67 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  28.67 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  28.85 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  28 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  28.33 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  32.2 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  32.2 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.37 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  23.59 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  32.74 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  35.24 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  35.24 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  33.33 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  29.38 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  23.66 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  32.48 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  31.93 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  23.47 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  28.15 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  32.48 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  32.2 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  37.33 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.63 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  40.51 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  22.18 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  31.25 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  30.77 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  22.18 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  36.8 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  29.01 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  31.16 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  30.09 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  37.33 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  25.12 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  35.23 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  34.65 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  27.42 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  32.74 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  30.17 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  34.67 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>