More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0267 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0267  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3754  ribokinase-like domain-containing protein  98.57 
 
 		 279 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.415543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0268  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  96.42 
 
 		 279 aa  521  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133044 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4458  carbohydrate kinase  95.7 
 
 		 279 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0383  ribokinase-like domain-containing protein  88.85 
 
 		 284 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0275  PfkB domain protein  87.77 
 
 		 283 aa  480  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0271  ribokinase-like domain-containing protein  88.13 
 
 		 283 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0278  ribokinase-like domain-containing protein  87.77 
 
 		 283 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.365265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0279  ribokinase-like domain-containing protein  87.81 
 
 		 283 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4799  ribokinase-like domain-containing protein  74.19 
 
 		 279 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4412  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  75.63 
 
 		 279 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.209851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0078  ribokinase-like domain-containing protein  74.19 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0077  ribokinase-like domain-containing protein  70.71 
 
 		 281 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0098  PfkB  70.76 
 
 		 282 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00218841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4125  ribokinase-like domain-containing protein  69.31 
 
 		 280 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3518  carbohydrate kinase  70.76 
 
 		 292 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  29.55 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  28.26 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  25.26 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  25.76 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  28.15 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  24.65 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  27.2 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  28.04 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  27.34 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  25.81 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  24.18 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  26.85 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  25.25 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  26.69 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3352  ribokinase family sugar kinase  27.16 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38232  decreased coverage  0.00309735 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.47 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  28.04 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  26.15 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  23.72 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  28.33 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  27.31 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  25.56 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  24.9 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  24.9 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  29.91 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  26.21 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  26.21 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  26.64 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  25.81 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  25.79 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  26.21 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  24.25 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  24 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  23.13 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  22.22 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  24.66 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  25.47 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  25.16 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  22.22 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  22.34 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  25.65 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  27.85 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  26.16 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  27.85 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  26.07 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  24.21 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  26.52 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  27.35 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  26.71 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  23.26 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  25.26 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  22.34 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  25.58 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  25.09 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  25.09 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  22.22 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  24.54 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  25.09 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  25.09 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  29.27 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  24.11 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  28.12 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6168  PfkB domain protein  24.6 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  hitchhiker  0.00391077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  23.08 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  27.13 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  26.4 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  27.13 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  26.28 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  26.37 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  24.82 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0498  carbohydrate kinase, PfkB  30.67 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  22.53 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25.48 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2767  putative carbohydrate kinase  26.33 
 
 		 385 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.634409  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  21.84 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  21.52 
 
 		 404 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  26.5 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  21.84 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  21.84 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  25 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  21.84 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  23.6 
 
 		 363 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  25.3 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  22.97 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>