More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3352 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3352  ribokinase family sugar kinase  100 
 
 		 303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38232  decreased coverage  0.00309735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2113  PfkB domain protein  48.94 
 
 		 304 aa  269  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3511  PfkB domain protein  50.68 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.280812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4175  ribokinase-like domain-containing protein  48.33 
 
 		 316 aa  262  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4369  PfkB domain-containing protein  49.35 
 
 		 307 aa  248  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09710  PfkB domain protein  26.73 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1114  PfkB domain protein  31.97 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  26.79 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1951  PfkB  30.2 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1009  PfkB domain protein  31.3 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  26.67 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  25.94 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  27.66 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1355  ribokinase family sugar kinase  27.23 
 
 		 224 aa  67  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  28.47 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  31.16 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0383  ribokinase-like domain-containing protein  28.64 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  30.18 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  31.18 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  27.15 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  26.47 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  27.68 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  28.14 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  26.33 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  27.15 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  27.8 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  27.36 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.21 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  26.8 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  39.62 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  26.82 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  27.11 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  26.84 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  23.72 
 
 		 628 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  30.28 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  23.6 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  28.95 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  23.15 
 
 		 628 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  27.85 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3754  ribokinase-like domain-containing protein  27.43 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.415543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  27.21 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03224  fructoselysine 6-kinase  25.53 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0339  PfkB domain protein  25.53 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  25.53 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03176  hypothetical protein  25.53 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3569  fructoselysine 6-kinase  25.53 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  28.43 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0267  ribokinase-like domain-containing protein  26.99 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045197 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  25.89 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  27.15 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0279  ribokinase-like domain-containing protein  27.8 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  24.43 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  26.45 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3751  fructoselysine 6-kinase  25.53 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  25.96 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  25.57 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4458  carbohydrate kinase  28.57 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  27.27 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  26.17 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0339  fructoselysine 6-kinase  25.53 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0268  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.8 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133044 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  35.64 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0275  PfkB domain protein  28.05 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  27.36 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  26.18 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  24.91 
 
 		 407 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  45.12 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  21.59 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  21.59 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  22.77 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  21.59 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  21.54 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  24.06 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  26.25 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  24.66 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  26.1 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  26.42 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  25 
 
 		 630 aa  55.8  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4412  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.79 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.209851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  31.89 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  27.05 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  26.84 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  27.04 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  22.84 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  28.4 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  39.19 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  25.89 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  25.58 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  25.47 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  25.47 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0271  ribokinase-like domain-containing protein  27.6 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  29.39 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  26.59 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  27.84 
 
 		 333 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  24.32 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.95 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  27.66 
 
 		 333 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  24.32 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  27.16 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>