286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1114 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1114  PfkB domain protein  100 
 
 		 325 aa  626  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09710  PfkB domain protein  40.85 
 
 		 305 aa  265  8.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2113  PfkB domain protein  34.81 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4175  ribokinase-like domain-containing protein  36.08 
 
 		 316 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3511  PfkB domain protein  34.63 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.280812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3352  ribokinase family sugar kinase  33.33 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38232  decreased coverage  0.00309735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4369  PfkB domain-containing protein  33.44 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  34.8 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  29.5 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  27.43 
 
 		 630 aa  73.2  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  35.47 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1951  PfkB  29.07 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  32.31 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  35.48 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  33.08 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  30.9 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  30.9 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  33.6 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  31.23 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  34.58 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  28.75 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  28.75 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  30.34 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  30.67 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  35.02 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  27.97 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  25.34 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  30.4 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29.63 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  30.65 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.07 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  30.23 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  24.91 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  27.53 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  29.2 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  29.74 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  32.25 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  31.69 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  29.37 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1009  PfkB domain protein  32.84 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  31.34 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  23.76 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  29.31 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  30.85 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  30.35 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3945  carbohydrate kinase, PfkB  28.73 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082303  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  29.02 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  29.49 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  30.71 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  30.22 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  31.62 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  26.3 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  24.26 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  25.82 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  27.39 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  32.16 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  25 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  29.18 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  27.64 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  29.49 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.33 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  32.59 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.38 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  33.33 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  33.33 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  28.67 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.2 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03224  fructoselysine 6-kinase  28.5 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0339  PfkB domain protein  28.5 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3751  fructoselysine 6-kinase  28.5 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03176  hypothetical protein  28.5 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3569  fructoselysine 6-kinase  28.5 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  32.28 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  23.75 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  25.18 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.33 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  24.92 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  30 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0339  fructoselysine 6-kinase  28.5 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  34.24 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  29.47 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  27.48 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  33.19 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  32.65 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1355  ribokinase family sugar kinase  26.85 
 
 		 224 aa  54.3  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  27.72 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  29.72 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  28.57 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  28.95 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  28.48 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  28.24 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.23 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  27.16 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  29.92 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.24 
 
 		 291 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  30.24 
 
 		 316 aa  53.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>