284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3945 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007488  RSP_3945  carbohydrate kinase, PfkB  100 
 
 		 285 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082303  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3647  xylose isomerase domain-containing protein  81.75 
 
 		 292 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0212849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2845  ribokinase-like domain-containing protein  43.08 
 
 		 270 aa  148  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9147  Sugar kinase ribokinase family  31.93 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5455  ribokinase-like domain-containing protein  34.72 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354613  normal  0.536806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03224  fructoselysine 6-kinase  32.3 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3569  fructoselysine 6-kinase  32.3 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0339  PfkB domain protein  32.3 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3751  fructoselysine 6-kinase  32.3 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0339  fructoselysine 6-kinase  32.3 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03176  hypothetical protein  32.3 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  32.77 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0298  hypothetical protein  31.9 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  33.48 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3872  PfkB domain protein  25.98 
 
 		 281 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  28.48 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3914  PfkB domain-containing protein  25.62 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3806  PfkB domain protein  25.62 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3975  PfkB domain-containing protein  25.27 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.971364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3794  PfkB domain protein  25.62 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  32.74 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  29.41 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  30.31 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  27.89 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  24.35 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  32.03 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  28.46 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  27.17 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  29.46 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  28.46 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  29.46 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  26.91 
 
 		 630 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  23.91 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  32.95 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  26.83 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  24.81 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  30.38 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.14 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  23.88 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  28.63 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  25.45 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  23.04 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  23.04 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  23.04 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  26.53 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  28.63 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  28.47 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  29.49 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  26.94 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  24.91 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  27.16 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  29.48 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4175  ribokinase-like domain-containing protein  28.81 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  22.95 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  22.69 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  29.13 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  28.57 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0322  1-phosphofructokinase  30.53 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000799963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1114  PfkB domain protein  28.25 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  29.2 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  24.78 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  27.4 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  29.55 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  28.11 
 
 		 319 aa  52.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  26.75 
 
 		 363 aa  52.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  26.12 
 
 		 307 aa  52.4  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  20.96 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  30.83 
 
 		 304 aa  52.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  23.31 
 
 		 313 aa  52.4  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  29.3 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  25.84 
 
 		 301 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2162  PfkB domain protein  30.58 
 
 		 326 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0183703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  28.21 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  27.76 
 
 		 353 aa  51.6  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  26.45 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  28.99 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  26.45 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  24.81 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  21.88 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.33 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  24.65 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04860  argininosuccinate lyase  28.1 
 
 		 823 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  25.85 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  23.51 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  25.25 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  21.64 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  26.22 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  30.19 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1193  PfkB domain protein  23.13 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.8184  normal  0.176819 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  26.85 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  24.82 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  29.18 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  29.32 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  27.92 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  28.04 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  24.81 
 
 		 338 aa  49.3  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  28.04 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0921  ketohexokinase  29.01 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>