More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2845 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2845  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 270 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3945  carbohydrate kinase, PfkB  43.08 
 
 		 285 aa  148  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082303  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3647  xylose isomerase domain-containing protein  40.75 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0212849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  33.46 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0339  fructoselysine 6-kinase  33.08 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3751  fructoselysine 6-kinase  32.69 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03224  fructoselysine 6-kinase  32.69 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0339  PfkB domain protein  32.69 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3569  fructoselysine 6-kinase  32.69 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03176  hypothetical protein  32.69 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5455  ribokinase-like domain-containing protein  31.84 
 
 		 313 aa  86.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354613  normal  0.536806 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9147  Sugar kinase ribokinase family  31.92 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0298  hypothetical protein  29.82 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  32.65 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.69 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  31.38 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  31.38 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  32.3 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  30.21 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  28.97 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  31.36 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  31.21 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  32.44 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  31.2 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  30.34 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  30.34 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  30.71 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  32.55 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.25 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.75 
 
 		 326 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  26.56 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  29.1 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  29.46 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28.09 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  28.48 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  31.28 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0597  ribokinase-like domain-containing protein  30.18 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  27.57 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2848  ketohexokinase  28.19 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.12 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  31.46 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  33.33 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  31.94 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3639  kinase, pfkB family  26.61 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000277248  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  24.73 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  26.14 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  31.49 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  29.14 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  30.53 
 
 		 331 aa  62  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  30.56 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  27.27 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  30.08 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  29.86 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  28.16 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  30.45 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  31.91 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  27.9 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  28.16 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  32.38 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  31.89 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  28.52 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  44.44 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  28.06 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  28.06 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  33.06 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  29.34 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  29.78 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  26.3 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  27.21 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  28.46 
 
 		 355 aa  58.9  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.31 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  26.3 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  30.3 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  27.74 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  25.25 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  27.41 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  26.3 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  27.61 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  29.39 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  29.76 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  26.67 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  28.62 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2113  PfkB domain protein  26.83 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  31.97 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.92 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  25.87 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  22.05 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  27.66 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  28.3 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  32.2 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  25.95 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  26.3 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.71 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  35.35 
 
 		 709 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  29.07 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  23.78 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  29.77 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  27.7 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>