More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0339 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0339  fructoselysine 6-kinase  100 
 
 		 261 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3751  fructoselysine 6-kinase  99.62 
 
 		 261 aa  538  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03224  fructoselysine 6-kinase  99.23 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0339  PfkB domain protein  99.23 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3569  fructoselysine 6-kinase  99.23 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03176  hypothetical protein  99.23 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  98.85 
 
 		 261 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9147  Sugar kinase ribokinase family  34.15 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3872  PfkB domain protein  30.86 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3914  PfkB domain-containing protein  30.86 
 
 		 281 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3975  PfkB domain-containing protein  30.48 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.971364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3806  PfkB domain protein  30.48 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3794  PfkB domain protein  30.11 
 
 		 281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0298  hypothetical protein  31.21 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2845  ribokinase-like domain-containing protein  33.08 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5455  ribokinase-like domain-containing protein  36.21 
 
 		 313 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354613  normal  0.536806 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3945  carbohydrate kinase, PfkB  32.3 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082303  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  28.36 
 
 		 327 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  27.44 
 
 		 344 aa  85.9  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  30.2 
 
 		 303 aa  85.5  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  27.88 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  30.72 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3647  xylose isomerase domain-containing protein  29.23 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0212849 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  28.18 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  25 
 
 		 640 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  30.08 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 642 aa  78.6  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  26.22 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 635 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.37 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  27.87 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  27.87 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  27.87 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3511  PfkB domain protein  27.48 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.280812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  26.98 
 
 		 636 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  29.81 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  29.51 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  27.86 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  30.84 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  29.81 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  21.59 
 
 		 645 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  28.78 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  26.28 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  27.21 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  25.08 
 
 		 634 aa  72.4  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  25.57 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  23.6 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  25.79 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  26.92 
 
 		 646 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  27.21 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  25.82 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  26.97 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  29.39 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  25.79 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  26.09 
 
 		 630 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  27.21 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  27.49 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  26.46 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  30.15 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  24.91 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.42 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  28.42 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  28.87 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  25.61 
 
 		 652 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  28.87 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  26.53 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.41 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  27.95 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  29.89 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2113  PfkB domain protein  27.69 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  26.74 
 
 		 329 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  27.93 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  29.23 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  26.1 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  28.96 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  27.21 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  27.65 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  27.61 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  24.04 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  25.84 
 
 		 403 aa  65.5  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  29.07 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  28.97 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  28.4 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  26.58 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  28.15 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  24.24 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  28.06 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  26.78 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  25.26 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  29.09 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  26.97 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  28.4 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4175  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  25.42 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  25.47 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  26.58 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>