More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0649 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 308 aa  624  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  41.64 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  40.4 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  39.86 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  34.72 
 
 		 292 aa  178  9e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  37.07 
 
 		 293 aa  175  8e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  32.18 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  32.29 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  37.54 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  35.88 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  35.27 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  35.27 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  36.15 
 
 		 294 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  32.42 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  27.97 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  31.99 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  32.63 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  29.72 
 
 		 301 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.45 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  34.23 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  29.59 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  35.49 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  30.61 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  30.77 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  30.82 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  32.42 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  32.46 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  33.2 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.59 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  27.15 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  27.49 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  26.96 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  32.03 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  29.57 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  26.27 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  29.45 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  29.62 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  32.03 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  32.03 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.7 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  32.03 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  23.97 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  26.78 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  28.52 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  28.16 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  25.18 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  25.4 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  29.89 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  24.19 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  29.89 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  30.42 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  29.89 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  31.89 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  27.18 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  27.84 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  27.76 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  26.81 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  31.18 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  29.73 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  24.44 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  24.91 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  31.4 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  31.44 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17531  putative carbohydrate kinase  25.65 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  28.84 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0100  putative fructokinase  28.11 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.14054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  25.87 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.31 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  27.86 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.71 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25.42 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  25.37 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  30 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  29.92 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  26.6 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  23.36 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  28.78 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  27.94 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  23.27 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl514  fructokinase  23.38 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  24.69 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  25.42 
 
 		 644 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.95 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  27.87 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  27.3 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  28.42 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  25.52 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  28.67 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  26.5 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  30.2 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  29.35 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.2 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  26.06 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10546  predicted protein  28.16 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  28.63 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  24.68 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>