More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4230 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  100 
 
 
302 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  39.59 
 
 
300 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  40.48 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  34.51 
 
 
292 aa  169  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  30.56 
 
 
296 aa  154  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  30.31 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  31.14 
 
 
300 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.38 
 
 
298 aa  132  6e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  31.76 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  31.23 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  29.69 
 
 
299 aa  128  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  30.45 
 
 
297 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  30.61 
 
 
308 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  28.04 
 
 
301 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  26.88 
 
 
324 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  32.75 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  33.33 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  34.38 
 
 
320 aa  116  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  32.18 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  33.47 
 
 
294 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  33.58 
 
 
305 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  32.2 
 
 
303 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  32.2 
 
 
303 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  31.56 
 
 
296 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.11 
 
 
323 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  26.17 
 
 
319 aa  92.4  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  26.17 
 
 
319 aa  92.4  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  27.85 
 
 
324 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  21.97 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  28.44 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  25.72 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.79 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  28.34 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  30.38 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  25.64 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  27.54 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  28.52 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  25 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  29.45 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  29.03 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  26.33 
 
 
313 aa  79  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  26.33 
 
 
313 aa  79  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  26.33 
 
 
313 aa  79  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  29.03 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  33.07 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  27.67 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  30.04 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  25.63 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.29 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  26.33 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  27.13 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.13 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  30.8 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  28.2 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  30.36 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.62 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  27.67 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  31.35 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.49 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  27.87 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  27.54 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  30.19 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  29.84 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  25.71 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  30.38 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  29.03 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  29.52 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  28.8 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  29.6 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  24.31 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  30.43 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1204  putative carbohydrate kinase  26.82 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0100  putative fructokinase  29.36 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.14054  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  26.77 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  30.74 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  24.31 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  30.45 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  26.69 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  27.1 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  32.61 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.34 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  26.71 
 
 
355 aa  67  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  28.06 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  27.6 
 
 
309 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  30.07 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  28.84 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  25.16 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  24.68 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1720  putative carbohydrate kinase  24.75 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.259189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  24.13 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18371  putative carbohydrate kinase  24.49 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.455738  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  27.48 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  31.71 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  32.73 
 
 
319 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  30.83 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  26.25 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  30.71 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  28.52 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>