More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0095 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  100 
 
 
294 aa  597  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  46.08 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  45.27 
 
 
305 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  51.55 
 
 
294 aa  242  6e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  42.57 
 
 
320 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  40.7 
 
 
311 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  40.28 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  39.13 
 
 
303 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  39.13 
 
 
303 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  36.15 
 
 
308 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  38.13 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  32.85 
 
 
296 aa  147  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  34.53 
 
 
299 aa  145  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  36.99 
 
 
300 aa  139  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.49 
 
 
298 aa  138  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  32.86 
 
 
303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  36.04 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  30.47 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  34.49 
 
 
305 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  31.65 
 
 
292 aa  124  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  33.33 
 
 
300 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  31.69 
 
 
300 aa  123  4e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  33.58 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  31.74 
 
 
312 aa  116  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  37.93 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  33.47 
 
 
302 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  24.65 
 
 
300 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  30.17 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  28.92 
 
 
319 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  29.41 
 
 
323 aa  86.7  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  30.79 
 
 
311 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  30.82 
 
 
298 aa  85.5  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  32.43 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  28.22 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  29.57 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  30.83 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  32.43 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.71 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  27.53 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  27.87 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  27.87 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  27.5 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  32.85 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  29.97 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  26.14 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  26.14 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  27.14 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  29.05 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  28.98 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  26.72 
 
 
319 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  27.1 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  26.37 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  25.69 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  28.17 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  24.16 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  28.11 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.46 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  29.18 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  27.92 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  26.74 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  29.53 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  29.12 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  25.09 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  28.98 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1299  bifunctional ADP-heptose synthase  31.27 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1290  rfaE bifunctional protein  26.67 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.106058  normal  0.821378 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  29.26 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  27.95 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  29.77 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  30.08 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  29.58 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  28.95 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  26.64 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  28.77 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  30.19 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2884  ribokinase-like domain-containing protein  31.67 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  28.68 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  27.21 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  30.8 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  33.46 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  32.96 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  26.22 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  28.01 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  30.59 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  31.67 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  30.59 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  23.16 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  29.61 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  30.98 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  26.22 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  26.22 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  27.21 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  31.15 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  29.2 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  26.71 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.09 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01731  putative carbohydrate kinase  29.31 
 
 
346 aa  65.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  29 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  31.34 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  28.63 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>