More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1600 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  100 
 
 		 305 aa  625  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  52.56 
 
 		 297 aa  295  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  42.24 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  36.75 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  33.77 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  32.5 
 
 		 300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  31.88 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.45 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  34.84 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  28.72 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  36.39 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  31.74 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  29.15 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  34.42 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  34.65 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  34.28 
 
 		 293 aa  129  8.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  29.28 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  34.49 
 
 		 294 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  31.23 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  27.3 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  34.27 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  35.31 
 
 		 294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  32.99 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  31.96 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  31.96 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.96 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  29.43 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  30.82 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  29.43 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  27 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  26.05 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  26.05 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.85 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  24.6 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  24.6 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  24.6 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  26.49 
 
 		 311 aa  86.3  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  24.6 
 
 		 319 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  26.35 
 
 		 324 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  25 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.21 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  23.95 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  26.33 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  24.76 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  27.31 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  25.99 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  23.66 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  25.48 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  25.15 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  30.03 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  26.52 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  27.09 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  26.39 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  25.81 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  27.36 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  28.73 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.41 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  24.68 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  25.86 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  24.77 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  28.62 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  26.62 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  28.16 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  24.83 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  27.87 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  28.71 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  28.57 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  26.43 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  27.93 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  26.01 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  24.41 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  26.89 
 
 		 398 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  25.82 
 
 		 670 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  25.24 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  24.46 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  24.37 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  28.24 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  24.28 
 
 		 652 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  23.47 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  26.97 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  23.67 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  26.83 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  29.12 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  26.92 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  28.48 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  24.08 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  27.48 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  28.3 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  24.69 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  27.02 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  25.39 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  27.07 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  25.41 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  28.2 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  23.18 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  24.74 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  24.74 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  24.73 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  29.82 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>