More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1054 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  100 
 
 
300 aa  615  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  40.35 
 
 
292 aa  223  4e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  43.66 
 
 
300 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  35.59 
 
 
296 aa  204  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  39.59 
 
 
302 aa  192  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  38.78 
 
 
312 aa  189  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  32.98 
 
 
303 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.05 
 
 
298 aa  178  8e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  34.83 
 
 
297 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  33.55 
 
 
324 aa  170  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  34.01 
 
 
300 aa  169  5e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  35.88 
 
 
308 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  34.59 
 
 
299 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  36.49 
 
 
311 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  32.5 
 
 
305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  32.04 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  35.23 
 
 
320 aa  149  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  29.27 
 
 
301 aa  148  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  34.69 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  36.43 
 
 
296 aa  126  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  34.24 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  35.57 
 
 
320 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  33.33 
 
 
294 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  25.96 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  32.65 
 
 
294 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  30.43 
 
 
303 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  30.43 
 
 
303 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  28.92 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.34 
 
 
323 aa  92.8  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  28.35 
 
 
323 aa  92.4  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  28.47 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.54 
 
 
322 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.06 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  26.3 
 
 
307 aa  86.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  26.93 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  25.76 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  26.98 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  25.96 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  27.62 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  28.53 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  26.98 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.05 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  27.44 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  27.46 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  28.35 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  29.03 
 
 
319 aa  79  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  27.96 
 
 
327 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  26.52 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  28.81 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  25.7 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  26.64 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  28.63 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  27.15 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  27.36 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  24.3 
 
 
323 aa  77  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  27.94 
 
 
316 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  25.57 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.33 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  25.57 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.27 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  27.49 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  27.15 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  24.43 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  29.08 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  27.37 
 
 
311 aa  75.5  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  22.98 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  25.91 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18191  putative carbohydrate kinase  28.07 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  23.75 
 
 
644 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  28.9 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0639  PfkB  28.73 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  24.37 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18161  putative carbohydrate kinase  27.46 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.409365  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  28.41 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  29.15 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  27.92 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  25.71 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  25.71 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  26.87 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  25.71 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  27.69 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  29.89 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  24.08 
 
 
644 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  29.89 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  27.68 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  26.77 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  28.41 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  25.72 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  28.73 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  28.73 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  28.73 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  26.6 
 
 
645 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  27.93 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  28.39 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  28.73 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  27.1 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  29.07 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01731  putative carbohydrate kinase  26.02 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>