More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2911 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  100 
 
 
320 aa  654    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  51.85 
 
 
311 aa  308  9e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  46.28 
 
 
296 aa  259  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  43.28 
 
 
294 aa  222  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  45.15 
 
 
305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  41.58 
 
 
293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  42.03 
 
 
294 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  40.4 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  36.91 
 
 
303 aa  179  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  36.91 
 
 
303 aa  179  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  38.46 
 
 
300 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  34.03 
 
 
292 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  33.89 
 
 
303 aa  146  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  34.65 
 
 
305 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  31.36 
 
 
296 aa  134  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  31.72 
 
 
299 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  35.57 
 
 
300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  34.15 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  32.09 
 
 
324 aa  125  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  35.43 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  29.37 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  35.07 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  30.93 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  30.39 
 
 
306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  29.68 
 
 
301 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  31.47 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.01 
 
 
298 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  30.55 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  30 
 
 
355 aa  86.3  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.36 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.04 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  28.36 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  29.03 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  27.88 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  23.95 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  30.8 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  27.24 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  29.62 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  27.51 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  26.95 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  30.21 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  27.51 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  26.8 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  25.68 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  26.92 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  29.3 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.23 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  29.39 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  29.43 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  28.15 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  28.74 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  28.74 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  26.14 
 
 
337 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  28.33 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  28.32 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  28.38 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  28.37 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  28.72 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  24.18 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  25.7 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  28.93 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  27.97 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  24.83 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  27.74 
 
 
339 aa  62.8  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  23.87 
 
 
301 aa  63.2  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  24.82 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  26.32 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17531  putative carbohydrate kinase  27.66 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  28.37 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  23.28 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  24.77 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  26.21 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  28.49 
 
 
347 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  25.28 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  26.21 
 
 
316 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  27.57 
 
 
316 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  28.09 
 
 
317 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  24.54 
 
 
322 aa  60.1  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  26.34 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  23.53 
 
 
301 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  26.22 
 
 
326 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  27.08 
 
 
319 aa  59.7  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  26.21 
 
 
330 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  24.47 
 
 
318 aa  59.3  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  29.45 
 
 
312 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  28.62 
 
 
319 aa  59.3  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 
312 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  26.21 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  26.94 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  25.27 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  29.09 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  26.21 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  25.2 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  25.53 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  26.21 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1204  putative carbohydrate kinase  28.84 
 
 
338 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  29.72 
 
 
336 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  24.4 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  26.49 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>