More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1998 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  100 
 
 		 312 aa  639    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  38.78 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  32.09 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  33.77 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  29.69 
 
 		 303 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  31.76 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  36.64 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  32.23 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  32.77 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  32.43 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  34.8 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  28.96 
 
 		 301 aa  138  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  36.03 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  32.09 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.11 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  26.3 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  32.31 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  31.76 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  29.28 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  32.76 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  33.11 
 
 		 305 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  31.74 
 
 		 294 aa  116  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  30.93 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.19 
 
 		 322 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  30.95 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.8 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  27.74 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  27.74 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  26.58 
 
 		 625 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  26.27 
 
 		 654 aa  89.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  26.27 
 
 		 656 aa  89.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  26.27 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  28.12 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  27.91 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  27.91 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  24.28 
 
 		 636 aa  82.8  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  26.32 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  24.6 
 
 		 647 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  23.2 
 
 		 634 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  25.7 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  26.35 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  28.57 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.1 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25.39 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  27.16 
 
 		 640 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  26.63 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  22.88 
 
 		 634 aa  79  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  26.88 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  27.65 
 
 		 635 aa  79  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  29.14 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  24.92 
 
 		 643 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  25.32 
 
 		 642 aa  77  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  25.76 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  24.84 
 
 		 644 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  25.88 
 
 		 659 aa  75.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  28.79 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  29.08 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  25.64 
 
 		 670 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  24.46 
 
 		 645 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  25.3 
 
 		 636 aa  74.7  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  24.15 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  24.92 
 
 		 644 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  26.27 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  25.31 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  24.92 
 
 		 646 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  24.7 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  27.96 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  23.71 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  24.75 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  28.12 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  28.12 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  28.12 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  25 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  25.45 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  26.38 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  29.85 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  27.22 
 
 		 633 aa  72.4  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  23.71 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  24.04 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  26.1 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  27.19 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  25.8 
 
 		 655 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  24.44 
 
 		 645 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  23.38 
 
 		 647 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  25.98 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  24.35 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  25.61 
 
 		 634 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  25.42 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  23.68 
 
 		 681 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  29.47 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  24.38 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  24.34 
 
 		 680 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  26.36 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  25.44 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  24.44 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  25.99 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  26.85 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  24.83 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>