More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1550 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  100 
 
 		 303 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  100 
 
 		 303 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  38.44 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  38.05 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  36.58 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  39.26 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  39.13 
 
 		 294 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  35.47 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  33.7 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  37.42 
 
 		 294 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  35.27 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  31.56 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  31.21 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  35.74 
 
 		 320 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  30.1 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  28.99 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  31.32 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  31.99 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  31.96 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  28.12 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  30.43 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  27.97 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  29.17 
 
 		 333 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  27.74 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.07 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  28.85 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  29.84 
 
 		 322 aa  92.4  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  27.37 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  32.42 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  22.22 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  29.24 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  28.4 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  28.75 
 
 		 325 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  26.9 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.33 
 
 		 323 aa  86.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  28.57 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  28.76 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  25.86 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  28.66 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.4 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  27.09 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  30.31 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  27.81 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  27.97 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  27.81 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.91 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  27.42 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  27.72 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  27.87 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  26.82 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  20.77 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.1 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  23.1 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.08 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0100  putative fructokinase  27.76 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.14054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  28.71 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  27.61 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.97 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  23.1 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  25.09 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  27.33 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  27.96 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  26.2 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  27.66 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  27.84 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.54 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  25.1 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  29.82 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18161  putative carbohydrate kinase  21.17 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.409365  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  27.48 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  30.1 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  28.57 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  24.82 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  28.47 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  28.47 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  28.9 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  28.35 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  24.4 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  26.79 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  27.81 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.84 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  26.39 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.84 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.21 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  29.54 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.47 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  24.25 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  27.96 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  30.94 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  29.67 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  25.73 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  27.68 
 
 		 343 aa  62.4  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  23.43 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.82 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  25.67 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>