More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0018 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  100 
 
 
300 aa  594  1e-169  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  33.68 
 
 
292 aa  155  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 
296 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  27.97 
 
 
308 aa  149  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  31.97 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  30.3 
 
 
306 aa  133  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  27.55 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  26.3 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  27.7 
 
 
297 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  30.28 
 
 
311 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  27.3 
 
 
305 aa  122  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  26.21 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  29.21 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  29.37 
 
 
320 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  28.82 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  29.66 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  25.96 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.15 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  25.95 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  29.51 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  24.65 
 
 
294 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  25.86 
 
 
305 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.85 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  26.13 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  22.22 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  22.22 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  21.92 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  25.94 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.52 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  25.9 
 
 
319 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  25.27 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  24.8 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  26.95 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  26.2 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  27.73 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  24.09 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  23.57 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  25 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  23.27 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  23.27 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  23.27 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  24.75 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  25.56 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  23.83 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  22.73 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  23.22 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  22.91 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  27.66 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  23.64 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  23.71 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  24.38 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  23.89 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  23.72 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  27.59 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  23.55 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  26.67 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  23.08 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  26.28 
 
 
317 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  25.25 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  22.86 
 
 
335 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  25.25 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  21.99 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  25.09 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  23.4 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  24.63 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  19.3 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  22.14 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  24.32 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  20.57 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  24.79 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  24.79 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  18.95 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  24.1 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  28.82 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  24.79 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  22.56 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  24.38 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  24.38 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  22 
 
 
338 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  22.86 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  21.53 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  20.22 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  24.38 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  24.91 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  24.07 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  24.08 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  24.38 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  23.48 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  25.82 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  24.38 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  24.38 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  22.63 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  27.24 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  23.49 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  22.53 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  25.19 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  26.48 
 
 
317 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  21.86 
 
 
322 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>