More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1796 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  100 
 
 		 293 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  47.08 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  46.08 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  42.71 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  41.58 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  38.19 
 
 		 294 aa  192  7e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  38.06 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  37.07 
 
 		 308 aa  175  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  32.98 
 
 		 296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  35.47 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  35.47 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  34.72 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  35.27 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  34.69 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  33.56 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  32.74 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  32.03 
 
 		 303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  34.28 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  32.31 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  31.27 
 
 		 324 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.77 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  28.23 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  31.47 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  25.95 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  30.22 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  33.2 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  29.49 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  30.47 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  32.74 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  30.67 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.04 
 
 		 329 aa  89.7  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  32.45 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  26.99 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  28.9 
 
 		 307 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.15 
 
 		 306 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  30.03 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  26.82 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  24.43 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  29.02 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  28.14 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  26.82 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  24.1 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  24.43 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  28.62 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  28.57 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  29.32 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  24.43 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  24.1 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  26.24 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  26.57 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  30.77 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl514  fructokinase  26.82 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.58 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  26.22 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  26.92 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  27.34 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  28.47 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  26.94 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  26.32 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  26.64 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  27.47 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18161  putative carbohydrate kinase  27.66 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.409365  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  26.09 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  28.67 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  27.04 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  29.3 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  27.76 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  27.65 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  28.09 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  26.14 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  28.36 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  26.39 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  27.38 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  27.59 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  27.38 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  25.9 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  24.92 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  25.65 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  30.16 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  25.76 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  25.48 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  26.62 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  26.5 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  24.91 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  25.7 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  26.43 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  24.83 
 
 		 645 aa  69.3  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  26.6 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  28.02 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  26.26 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  25.18 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  24.76 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  26.03 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  26.71 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  26.45 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  25 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  26.06 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>