More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1193 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1193  PfkB domain protein  100 
 
 		 306 aa  616  1e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.8184  normal  0.176819 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  48.52 
 
 		 305 aa  268  8e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  44.34 
 
 		 308 aa  232  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  38.56 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  42.05 
 
 		 305 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  35.39 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  35.83 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  41.45 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  39.1 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  37.95 
 
 		 302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  36.89 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  35.62 
 
 		 310 aa  178  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  39.02 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  38.76 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  36.42 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  38.69 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  36.72 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  35.29 
 
 		 310 aa  175  9e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  37.25 
 
 		 302 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  38.89 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  37.92 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  37.58 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  36.63 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  36.96 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  39.22 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  38.76 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  37.13 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  37.37 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  38.64 
 
 		 305 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  37.13 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  39.67 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  38.76 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  38.76 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  36.48 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  37.46 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  34.43 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  34.65 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  38.82 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  34.95 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  37.54 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  37.17 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  35.18 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  40.19 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  36.39 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  37.37 
 
 		 295 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  36.72 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  37.3 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  32.89 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  35.6 
 
 		 340 aa  158  9e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  35.18 
 
 		 307 aa  158  9e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  35.06 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  37.62 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  36.75 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  34.43 
 
 		 403 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  34.42 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  37.33 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  35.28 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  39.4 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  34.94 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  40.26 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  35.06 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  35.95 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  33.44 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  36.75 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  36.07 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  36.16 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  34.65 
 
 		 298 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  37.09 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  37.29 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  35.48 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  34.97 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  38.24 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  34.97 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1363  ribokinase-like domain-containing protein  37.91 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  34.1 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  34.41 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  34.64 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  35.48 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  36.57 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  36.09 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  31.48 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  34.2 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  38.56 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  34.67 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  34.67 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  36.33 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  36.18 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  34.64 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  34.42 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  32.69 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  36.88 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  34.2 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  36.33 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  36.16 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  33.44 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  32.79 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  36.16 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  36.16 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  36.16 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>