193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3872 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3872  PfkB domain protein  100 
 
 
281 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3914  PfkB domain-containing protein  97.86 
 
 
281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3806  PfkB domain protein  98.58 
 
 
281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3794  PfkB domain protein  97.86 
 
 
281 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3975  PfkB domain-containing protein  97.86 
 
 
281 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.971364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0298  hypothetical protein  35.99 
 
 
303 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9147  Sugar kinase ribokinase family  34.66 
 
 
288 aa  158  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3751  fructoselysine 6-kinase  30.86 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0339  fructoselysine 6-kinase  30.86 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.457632 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03224  fructoselysine 6-kinase  30.48 
 
 
261 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0339  PfkB domain protein  30.48 
 
 
261 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03176  hypothetical protein  30.48 
 
 
261 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3569  fructoselysine 6-kinase  30.48 
 
 
261 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  30.48 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5455  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354613  normal  0.536806 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3945  carbohydrate kinase, PfkB  25.98 
 
 
285 aa  72  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082303  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3647  xylose isomerase domain-containing protein  24.64 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0212849 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  27.02 
 
 
304 aa  62.8  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  27.91 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  25 
 
 
315 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  25 
 
 
315 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  24.6 
 
 
315 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  24.6 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  24.6 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  24.6 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  22.57 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  25.27 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.9 
 
 
315 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  24.73 
 
 
312 aa  56.6  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  27.61 
 
 
307 aa  56.2  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  24.39 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  25.17 
 
 
324 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0423  PfkB domain protein  23.93 
 
 
305 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  23.66 
 
 
298 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  24.51 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2845  ribokinase-like domain-containing protein  25.46 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  26.32 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4286  putative carbohydrate kinase  23.5 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  24.24 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  25.62 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  23.21 
 
 
312 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  24.91 
 
 
311 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  25.59 
 
 
313 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0148  ribokinase-like domain-containing protein  22.59 
 
 
308 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  25.22 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  26.12 
 
 
298 aa  52.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  23.01 
 
 
311 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  24.57 
 
 
310 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  24.42 
 
 
284 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  26.67 
 
 
292 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  26.98 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  23.69 
 
 
298 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  26.22 
 
 
285 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  23.02 
 
 
325 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.97 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  24.56 
 
 
298 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  25.66 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  24.91 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  25.48 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  22.03 
 
 
325 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  24.19 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  23.27 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  23.77 
 
 
307 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  25.11 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  26.43 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  25.35 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  26.12 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  25.35 
 
 
315 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  26.5 
 
 
308 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 
300 aa  50.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  24.56 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  24.91 
 
 
298 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  25.5 
 
 
315 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  27.6 
 
 
307 aa  49.7  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  26.76 
 
 
315 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  24.56 
 
 
298 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  24.56 
 
 
298 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  25.33 
 
 
315 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  25.97 
 
 
288 aa  49.7  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  23.71 
 
 
344 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  22.49 
 
 
323 aa  49.3  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  24.91 
 
 
322 aa  49.3  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  24.91 
 
 
298 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  25.49 
 
 
313 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  24.41 
 
 
335 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  24.56 
 
 
298 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  24.45 
 
 
328 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  24.28 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3386  fructokinase, putative  22.8 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0217609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0526  fructokinase  22.8 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29396  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  25.54 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  26.15 
 
 
324 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  24.55 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3060  putative fructokinase  22.8 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2033  putative fructokinase  22.8 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  25.33 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0334  putative fructokinase  22.8 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894295  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0347  putative fructokinase  22.8 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2251  putative fructokinase  22.8 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.763261  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  24.04 
 
 
328 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>