More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0423 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0423  PfkB domain protein  100 
 
 
305 aa  620  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4286  putative carbohydrate kinase  94.43 
 
 
305 aa  544  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0148  ribokinase-like domain-containing protein  85.47 
 
 
308 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0334  putative fructokinase  74.66 
 
 
302 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3386  fructokinase, putative  74.66 
 
 
302 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0217609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0526  fructokinase  74.66 
 
 
302 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0347  putative fructokinase  74.66 
 
 
302 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2251  putative fructokinase  74.66 
 
 
302 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.763261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2033  putative fructokinase  74.66 
 
 
302 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3060  putative fructokinase  74.66 
 
 
302 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0298  fructokinase, putative  73.99 
 
 
302 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2969  ribokinase-like domain-containing protein  72.97 
 
 
302 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  73.31 
 
 
302 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2884  ribokinase-like domain-containing protein  72.97 
 
 
302 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6323  ribokinase family sugar kinase  73.31 
 
 
302 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2994  ribokinase-like domain-containing protein  73.99 
 
 
302 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2360  PfkB  73.99 
 
 
302 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2974  ribokinase-like domain-containing protein  73.99 
 
 
302 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  51.67 
 
 
307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  52.17 
 
 
312 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  52.17 
 
 
312 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  52.17 
 
 
312 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1714  ribokinase-like domain-containing protein  51.85 
 
 
319 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0308067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4680  PfkB, ribokinase family  51.51 
 
 
311 aa  254  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0234219  normal  0.218214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1462  ribokinase-like domain-containing protein  51.84 
 
 
316 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081481  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1422  ribokinase-like domain-containing protein  51.51 
 
 
316 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  48.68 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  49.82 
 
 
284 aa  236  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.67 
 
 
323 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  34.97 
 
 
314 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  33.11 
 
 
306 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  29.37 
 
 
315 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  37.91 
 
 
312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  35.16 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  31.27 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  32.16 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  32.29 
 
 
307 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  32.16 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  33.87 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  31.01 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  31.11 
 
 
309 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  33.67 
 
 
308 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  30.66 
 
 
304 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  28.75 
 
 
320 aa  106  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  27.83 
 
 
319 aa  106  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  32.16 
 
 
311 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  30.21 
 
 
308 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
319 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  31.36 
 
 
298 aa  103  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  30.83 
 
 
321 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  32.18 
 
 
322 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  28.94 
 
 
326 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  31.65 
 
 
319 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  31.65 
 
 
319 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  31.82 
 
 
312 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  30.58 
 
 
319 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  35 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  32.28 
 
 
308 aa  99.4  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  30.58 
 
 
319 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  32.02 
 
 
308 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  33.12 
 
 
306 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  31.49 
 
 
306 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  31.86 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  34.29 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  30.58 
 
 
319 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  31.66 
 
 
306 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  32.04 
 
 
307 aa  96.7  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  34.72 
 
 
309 aa  96.3  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  26.27 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  30.69 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  33.46 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.71 
 
 
337 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  36.4 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  33.58 
 
 
308 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  29.6 
 
 
319 aa  92.8  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  24.66 
 
 
315 aa  92.8  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  32.14 
 
 
306 aa  92.8  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  29.68 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  26.73 
 
 
322 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  24.66 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  31.44 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  31.07 
 
 
312 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  31.13 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.27 
 
 
313 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.27 
 
 
313 aa  89.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  33.76 
 
 
313 aa  89.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.27 
 
 
313 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  29.77 
 
 
308 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  31.44 
 
 
308 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  28.86 
 
 
335 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0100  putative fructokinase  31.71 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.14054  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  27.95 
 
 
333 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  32.64 
 
 
323 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  28.82 
 
 
319 aa  85.9  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  28.82 
 
 
319 aa  85.9  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  26.62 
 
 
313 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  31.29 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  27.95 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  30.07 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2162  PfkB domain protein  33.58 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0183703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>