183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1009 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1009  PfkB domain protein  100 
 
 
283 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1355  ribokinase family sugar kinase  40.41 
 
 
224 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1951  PfkB  33.74 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4175  ribokinase-like domain-containing protein  35.93 
 
 
316 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3352  ribokinase family sugar kinase  31.3 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38232  decreased coverage  0.00309735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2113  PfkB domain protein  31.58 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3511  PfkB domain protein  32.25 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.280812  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  31.18 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2845  ribokinase-like domain-containing protein  32.03 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1114  PfkB domain protein  33.33 
 
 
325 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  23.85 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.14 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  22.57 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0298  hypothetical protein  32.66 
 
 
303 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  24.16 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09710  PfkB domain protein  26.8 
 
 
305 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4369  PfkB domain-containing protein  28.79 
 
 
307 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  30.74 
 
 
373 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  32.75 
 
 
316 aa  59.3  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  30.5 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  22.9 
 
 
301 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  40.59 
 
 
311 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.35 
 
 
307 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  47.22 
 
 
273 aa  56.6  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  30.07 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  33.06 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  29.01 
 
 
314 aa  56.2  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  27.84 
 
 
307 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  26.26 
 
 
315 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6055  PfkB domain protein  54.1 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130249  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03224  fructoselysine 6-kinase  31.44 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0339  PfkB domain protein  31.44 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  30.62 
 
 
332 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03176  hypothetical protein  31.44 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  28.05 
 
 
322 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3569  fructoselysine 6-kinase  31.44 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0339  fructoselysine 6-kinase  31.44 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3751  fructoselysine 6-kinase  31.44 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  26.94 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  29.84 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2848  ketohexokinase  26.24 
 
 
290 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  30.46 
 
 
300 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  31.97 
 
 
346 aa  52.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  29.84 
 
 
317 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  29.84 
 
 
317 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  42.31 
 
 
300 aa  52.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  42.5 
 
 
306 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  25.38 
 
 
320 aa  51.6  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  43.75 
 
 
306 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  30.26 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  40.37 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3037  PfkB domain protein  27.67 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  29.89 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  31.76 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  40.24 
 
 
319 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  36.84 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  44.12 
 
 
324 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  42.05 
 
 
329 aa  50.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  24.72 
 
 
353 aa  50.4  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  20.75 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  29.46 
 
 
320 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  28.48 
 
 
320 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.5 
 
 
320 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  29.18 
 
 
284 aa  49.3  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  23.05 
 
 
319 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  23.05 
 
 
319 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  27.95 
 
 
334 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9147  Sugar kinase ribokinase family  27.95 
 
 
288 aa  49.3  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  20.97 
 
 
303 aa  48.9  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  26.33 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  25.2 
 
 
311 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  36.36 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  43.75 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  28.52 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  27.94 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  26.46 
 
 
310 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  33.21 
 
 
360 aa  48.5  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  34.35 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  26.69 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  26.91 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  50 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  30.95 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  25.28 
 
 
333 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  30.08 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  27.65 
 
 
296 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  29.32 
 
 
329 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.97 
 
 
308 aa  47  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0545  ribokinase-like domain-containing protein  41.76 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  40.54 
 
 
311 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4125  ribokinase-like domain-containing protein  32.97 
 
 
280 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  46.67 
 
 
313 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  25.93 
 
 
315 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  27.17 
 
 
311 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  29.13 
 
 
303 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2607  PfkB domain protein  27.63 
 
 
363 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000945109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  38.95 
 
 
309 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  24.91 
 
 
333 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  25.87 
 
 
310 aa  45.8  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  38.94 
 
 
316 aa  45.8  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>