More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2607 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2607  PfkB domain protein  100 
 
 
363 aa  729    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000945109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2897  ribokinase-like domain-containing protein  81.82 
 
 
387 aa  591  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5122  PfkB domain protein  57.23 
 
 
347 aa  351  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2767  putative carbohydrate kinase  53.09 
 
 
385 aa  349  5e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.634409  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2589  PfkB domain protein  55.75 
 
 
387 aa  344  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1520  PfkB domain protein  51.79 
 
 
371 aa  338  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.395402  normal  0.0514354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  49.59 
 
 
445 aa  331  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  51.11 
 
 
373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  28.81 
 
 
319 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  29.01 
 
 
319 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  32.41 
 
 
307 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5442  PfkB domain protein  35 
 
 
311 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  28.62 
 
 
307 aa  97.4  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  32.38 
 
 
307 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  30.89 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  30.59 
 
 
298 aa  86.3  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.77 
 
 
305 aa  84  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  25.25 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  28.99 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  27.22 
 
 
305 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  25.33 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  28.9 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  29.93 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  27.87 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  27.71 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  27.49 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  29.22 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  32.95 
 
 
304 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  28.29 
 
 
291 aa  77  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  40.48 
 
 
295 aa  77  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  28.76 
 
 
303 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  27.42 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  26.92 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  27.16 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  26.92 
 
 
298 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  26.92 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  26.92 
 
 
298 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  29.24 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.09 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  26.71 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  29.35 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  28.85 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  26.57 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  26.57 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  29.35 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  26.33 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  28.96 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  29.87 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  28.52 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  26.28 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  26.57 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  29.67 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  29.14 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  25.61 
 
 
298 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  29.14 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  29.14 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  26.92 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  26.22 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  29.14 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  26.87 
 
 
320 aa  72  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  26.47 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  24.2 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  28.52 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  26.47 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  24.92 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  29.32 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  25.09 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  28.95 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  27.21 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  28.78 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  26.28 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.45 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  27.96 
 
 
305 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  28.77 
 
 
302 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  30.74 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  30.74 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  30.74 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  26.95 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  27.48 
 
 
300 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  24.92 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  24.52 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  26.62 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  30.24 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  31.44 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.31 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  28.99 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  28.99 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.5 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  27.97 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  27.52 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  28.12 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  28.73 
 
 
314 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  24.6 
 
 
305 aa  67  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  26.91 
 
 
297 aa  67  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  28.15 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.3 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  26.95 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  27.63 
 
 
305 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  31.52 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  29.15 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>