More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5122 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5122  PfkB domain protein  100 
 
 		 347 aa  697    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2767  putative carbohydrate kinase  58.26 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.634409  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2607  PfkB domain protein  57.23 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000945109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2589  PfkB domain protein  55.49 
 
 		 387 aa  355  5e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2897  ribokinase-like domain-containing protein  55.62 
 
 		 387 aa  353  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1520  PfkB domain protein  57.18 
 
 		 371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.395402  normal  0.0514354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  55.03 
 
 		 373 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  51.6 
 
 		 445 aa  328  9e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  27.48 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  32.55 
 
 		 307 aa  92.8  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  27.51 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  30.64 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.49 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  28.85 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.86 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5442  PfkB domain protein  35.04 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.59 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  41.51 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  26.47 
 
 		 324 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  23.59 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  28.37 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.51 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  27.92 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  29.83 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  31.33 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  27.27 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  42.98 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  27.51 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.33 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.33 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.33 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  27.91 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  24.04 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  26.33 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.33 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.33 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.33 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.98 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  26.49 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  27.76 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  30.21 
 
 		 315 aa  67  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  25.55 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  27.67 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.87 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  39.39 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  42.16 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  25.78 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  26.42 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  23.33 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  29.13 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  27.39 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  27.91 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  26.67 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  32.73 
 
 		 313 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  24.34 
 
 		 312 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  25.24 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  25 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  25.16 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  29.73 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  29.97 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  28.08 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  28.39 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  28.25 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  34.78 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  34.26 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  22.88 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  30.47 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  27.51 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  27.91 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  33.9 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  31.93 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  25.44 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  24.91 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  45.68 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  25 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  26.6 
 
 		 298 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  33.06 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  27.48 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  26.33 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  28.34 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  27.22 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  27.45 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  36.75 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  26.09 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  28.57 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  27.34 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  34.86 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  33.56 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  26.95 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  28.48 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  25.71 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  30.2 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  31.05 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  36.89 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  24.66 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  25.16 
 
 		 298 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  27.65 
 
 		 304 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>