More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0932 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  100 
 
 
298 aa  617  1e-176  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  51.37 
 
 
294 aa  290  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  50.52 
 
 
299 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  50 
 
 
296 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  43.3 
 
 
302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  43.64 
 
 
302 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  42.27 
 
 
302 aa  249  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1658  ribokinase-like domain-containing protein  47.78 
 
 
298 aa  249  3e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.468132  normal  0.0440332 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  41.5 
 
 
299 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  41.02 
 
 
300 aa  236  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  39.18 
 
 
302 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  37.76 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3455  PfkB domain protein  30.66 
 
 
312 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327587  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  28.9 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  30.91 
 
 
310 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  27.78 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  27.78 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  31.11 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  29.97 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  31.16 
 
 
308 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  29.43 
 
 
308 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04263  sugar kinase  29.2 
 
 
362 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.383154  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  29.97 
 
 
310 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  29.52 
 
 
324 aa  105  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  29.82 
 
 
308 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  28.31 
 
 
311 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  27.72 
 
 
310 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3535  ribokinase-like domain-containing protein  28.48 
 
 
325 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32323  decreased coverage  0.000219352 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  26.89 
 
 
312 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  28.85 
 
 
324 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  28.32 
 
 
311 aa  99.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  26.89 
 
 
320 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  27.56 
 
 
289 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  29.47 
 
 
310 aa  99.4  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  27.57 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  27.72 
 
 
312 aa  99  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  27.68 
 
 
316 aa  99  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  27.72 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  27.3 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  27.72 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  27.72 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  27.3 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  27.72 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  28.86 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  27.72 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  27.72 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  26.78 
 
 
310 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  26.28 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  28.25 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3303  ribokinase-like domain-containing protein  28.25 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1798  adenosine kinase  28.25 
 
 
326 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  27.68 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  28.21 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  26.8 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  27.68 
 
 
311 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  27.46 
 
 
310 aa  95.5  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3120  adenosine kinase  28.75 
 
 
326 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  26.64 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  25.48 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  27.37 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  25.56 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  27.91 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  28.52 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  27.86 
 
 
319 aa  94  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  29.76 
 
 
339 aa  92.8  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3081  PfkB domain protein  28.03 
 
 
324 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  27.02 
 
 
311 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12230  carbohydrate kinase cbhK  27.44 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000530804  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  26.53 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  26.47 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  26.47 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2947  adenosine kinase  26.2 
 
 
323 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  26.91 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  26.32 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  26.32 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 
327 aa  89.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  26.32 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  26.19 
 
 
298 aa  89.4  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  28.57 
 
 
318 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  27.13 
 
 
329 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0480  PfkB domain protein  25.91 
 
 
275 aa  86.7  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1531  PfkB domain protein  27.67 
 
 
329 aa  86.3  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3063  PfkB domain protein  27.15 
 
 
324 aa  85.9  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142988  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  25.34 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3566  adenosine kinase  25.71 
 
 
323 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0415989  normal  0.0392481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3300  adenosine kinase  25.8 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3311  adenosine kinase  25.8 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353965  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3362  adenosine kinase  25.8 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0861  ribokinase-like domain-containing protein  26.39 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.035179  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  26.97 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3294  PfkB domain protein  27.71 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0953  PfkB domain protein  25 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  25.97 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  25.79 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  27.44 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4145  PfkB domain-containing protein  27.3 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786211  decreased coverage  0.0063394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3153  Adenosine kinase  25.88 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  24.41 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  27.05 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  28.14 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>