More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2589 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2589  PfkB domain protein  100 
 
 		 387 aa  767    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  59.03 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2767  putative carbohydrate kinase  53.49 
 
 		 385 aa  351  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.634409  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2607  PfkB domain protein  55.75 
 
 		 363 aa  344  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000945109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5122  PfkB domain protein  55.85 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2897  ribokinase-like domain-containing protein  54.02 
 
 		 387 aa  335  7e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  52.59 
 
 		 373 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1520  PfkB domain protein  51.57 
 
 		 371 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.395402  normal  0.0514354 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  30.61 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  33.11 
 
 		 314 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  30.56 
 
 		 307 aa  90.1  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  30.36 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5442  PfkB domain protein  33.68 
 
 		 311 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  26.8 
 
 		 319 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  28.24 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  31.33 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.21 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  28.01 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  28.03 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  26.87 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  27.9 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  25.89 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  26.75 
 
 		 307 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  26.45 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  27.21 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  27.21 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  26.87 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  26.87 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  26.97 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  25.55 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  27.1 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  26.87 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.04 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  29.43 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  34.4 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  27.55 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  26.53 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  26.53 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  30.23 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  27.03 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  29.15 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  26.53 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  28.48 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  26.09 
 
 		 645 aa  66.6  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  28.67 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  24.17 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  28.03 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  26.58 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.3 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  25.55 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  26.75 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  28.29 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.3 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.3 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  24.67 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  28.24 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  29.63 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  30.55 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  22.46 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  23.4 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  26.3 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  28.87 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.3 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.3 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  29.49 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  23 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  29.93 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.3 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  27.85 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  28.09 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  26.8 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0329  ribokinase-like domain-containing protein  25.62 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.810022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  29.7 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  23.13 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  23.13 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  28.77 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  23.13 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  29.08 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0597  ribokinase-like domain-containing protein  28.68 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  26.71 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  25.32 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  30.67 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.42 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  23.61 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  28.4 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  22.77 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  27.22 
 
 		 327 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  27.24 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  24.84 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  28.67 
 
 		 302 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  22.86 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  24.71 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  26.54 
 
 		 310 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  39.6 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  23.26 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  30.37 
 
 		 316 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  25.8 
 
 		 317 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  30.39 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>